lammps报错求助，lammps运行到一半终止模拟，并显示application aborted

城堡主人 · 发表于 Post on 2024-6-15 21:08:14

我想做有机物在760摄氏度 660摄氏度下的分解，在前辈给的In文件的基础上修改了一下，in文件如下

in-relax.txt (2.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 9) ，原本设计的跑4000000步，但是最后总是跑了600000步就自动终止了，显示信息如下Total # of neighbors = 217093
Ave neighs/atom = 328.92879
Neighbor list builds = 5000
Dangerous builds not checked
WARNING: One or more atoms are time integrated more than once (src/modify.cpp:289)
Setting up Verlet ru
job aborted:
[ranks] message
[0-1] terminated
[2] application aborted
aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 1, comm rank 2
[3] terminated
[4] application aborted
aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 1, comm rank 4
[5] terminated
---- error analysis -----
[2,4] on LAPTOP10JM00UJ
lmp aborted the job. abort code 1
---- error analysis -----
PS C:\TRY>
然后我查阅相关资料，说是用6核运行不行，或者是执行mpiexec -np 6 lmp -in .\in-relax.txt的时候，文件名错了，然后我该成4核，并且按tab键自动写文件名又试了一次，还是不行，想问下这是遇到了什么问题。
还有就是基于这600000步，前590000步都不分解，到最后100-200步突然就分解了，想问下这是出了什么问题，species文件是这么显示的
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8       O2
   599706       220          2       20       200
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8       O2
   599806       220          2       20       200
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8       O2
   599906       220          2       20       200
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8       O2
   600006       220          2       20       200
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8       O2
   600106       220          2       20       200
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8    C4O3H8       O2
   600206       219          3       19          1       199
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH8    C4O3H8       O2
   600306       219          3       19          1       199
#  Timestep No_Moles No_Specs    C4OH7       O4H    C4OH8    C4O3H8       O2H          H       O2
   600406       217          7          4          1       13          3          2          1       193
#  Timestep No_Moles No_Specs       C3H5       COH2       O2H    C4OH8       COH    CO2H2    C2O2H3          H    C4OH7    C2O2H4    C2OH3    C4OH5    C3O2H4       COH3    C4OH6       O4H    C4O3H6       H2    C4OH3    C4OH4       O2
   600506       230       21          1          1       21          2          1          1          1          9          5          1          1          2          1          1          4          1          1          2          1          1       172

这是我用的立场文件和初始建模

CHO.ff (7.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

TRY (31.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

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