计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 408|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 关于gaussian洋葱模型高层区求结合能问题

[复制链接 Copy URL]

74

帖子

0

威望

1109

eV
积分
1183

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 a-Student 于 2024-6-18 20:18 编辑

老师打扰下,请教问题,
1. gaussian计算oniom模型QM区是A和B分子络合形成的络合物,要想求QM区A和B分子的结合能,如何求呢?我知道正常模型下用E=EAB-EA-EB,但是oniom模型下需要考虑MM的影响,不确定如何求妥当,所以请教老师指点

2.oniom优化结构前输入文件给模型赋予电荷,基态的时候要个QM层和MM层原子全部赋予基态的电荷,优化激发态要赋予激发态电荷,这么操作正确么。
麻烦老师了,谢谢

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-6-18 18:55:19 | 只看该作者 Only view this author
那叫ONIOM

1 照样EAB-EA-EB

2 可以不用刻意给QM设置原子电荷,优化过程中Gaussian默认自动基于QM区的静电势拟合MK原子电荷来计算与MM层原子的静电相互作用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

74

帖子

0

威望

1109

eV
积分
1183

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-18 20:23:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-18 18:55
那叫ONIOM

1 照样EAB-EA-EB

谢谢老师,已修改。
再请教下,那EAB是ONIOM整体优化算出来就可以得到,EA和EB是也要用ONIOM把A或B单独作为QM区,放到OONIOM模型里算能量吗?再次麻烦您

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-6-19 05:11:06 | 只看该作者 Only view this author
a-Student 发表于 2024-6-18 20:23
谢谢老师,已修改。
再请教下,那EAB是ONIOM整体优化算出来就可以得到,EA和EB是也要用ONIOM把A或B单独 ...

通常是
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 14:09 , Processed in 0.156760 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list