用multiwfn和VMD查看静电势分布，在VMD中输入pt报错了

游水的鱼儿 · 发表于 Post on 2024-6-29 17:58:12

各位老师问好，在VMD中输入pt报错了，下面的图是报错信息，文件类型出错应该怎么修改呀，麻烦各位老师们帮忙解答一下，谢谢。
报错指令：（ERROR) Could not read file mol1.pdb
Unable to load file 'mol1.pdb' using file type 'pdb'.

乐平 · 发表于 Post on 2024-6-29 22:09:00

你要干什么？输入 pt 是什么意思……

游水的鱼儿 · 发表于 Post on 2024-6-29 22:33:58

您好，我是跟着下面这个图片做的，根据这篇文章http://sobereva.com/443

乐平 · 发表于 Post on 2024-6-29 23:47:40

游水的鱼儿发表于 2024-6-29 22:33
您好，我是跟着下面这个图片做的，根据这篇文章http://sobereva.com/443

那你按照 443 文章里的第 2 步 “本文涉及的文件和准备工作” 做了吗……

最后，为了绘图时敲的命令更简短，读者应当用文本编辑器打开VMD目录下的vmd.rc文件（对Windows版VMD而言），在最后添加以下内容：
proc iso {} {source ESPiso.vmd}
proc iso2 {} {source ESPiso2.vmd}
proc pt {} {source ESPpt.vmd}
proc pt2 {} {source ESPpt2.vmd}
proc ext {} {source ESPext.vmd}
之后在VMD的文本窗口里只要输入比如pt，就等价于输入source ESPpt.vmd来执行这个作图脚本了。注意运行这些命令前用户在VMD里最好没做过任何其它操作，否则应该重启VMD，否则可能看不到预期的效果。

sobereva · 发表于 Post on 2024-6-30 01:04:31

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “multiwfn和VMD查看静电势分布” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

sobereva · 发表于 Post on 2024-6-30 01:05:21

从头到尾一个字一个字认真阅读
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）

游水的鱼儿 · 发表于 Post on 2024-7-2 20:53:32

sobereva 发表于 2024-6-30 01:05
从头到尾一个字一个字认真阅读
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（ ...

好的好的，谢谢。问题解决了

游水的鱼儿 · 发表于 Post on 2024-7-2 20:53:59

sobereva 发表于 2024-6-30 01:05
从头到尾一个字一个字认真阅读
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（ ...

好的好的，谢谢

从头开始搞计算 · 发表于 Post on 2024-9-14 11:33:52

请问怎么解决的，我也这样

Jianggggg-rj · 发表于 Post on 2024-9-26 09:34:47

请问怎么解决的

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[波函数分析求助] 用multiwfn和VMD查看静电势分布，在VMD中输入pt报错了