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[NAMD] 锂离子参数问题

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本帖最后由 Scarlett1 于 2016-12-17 14:11 编辑

请问,在charmm立场官网中找到锂离子的top文件,在vmd中将其转化为psf后,在NAMD里跑平衡时出现“”charmm参数文件中没有此文件”的错误原因,这是为什么呢?top文件是toppar_water_ions.str。先谢谢大家指教了。参数文件如下

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报错.PNG

toppar_water_ions.str

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发表于 Post on 2016-12-17 14:06:28 | 只看该作者 Only view this author
提示你了,参数文件里有错误,把参数文件上传看看

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-17 16:42:04 | 只看该作者 Only view this author
问题已经解决了,是参数文件的问题,谢谢大家的关注!

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