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[Molclus] molclus做分子团簇构型搜索的能量计算求助

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楼主
老师您好,我用molclus做分子团簇构型搜索时,做完GFN-xTB初步筛选和DFT优化以后,在M062X/6-311G+(2d,p)计算高精度单点能以后再用isostat进行能量排序筛选最稳定结构,这时候的能量只有单点能,没有加上DFT优化的热力学矫正量,请问这样能量排序的结果可靠吗?是不是用M062X/6-311G+(2d,p)计算的高精度单点能再加上热力学校正能量再进行能量排序得到的能量最低结构更准确?因为我对比了只用高精度单点能进行排序和高精度单点能加上热力学校正量的自由能进行排序,发现在高精度单点能相差不大的情况下,这两种排序方式能量最低的结构有所差异,此时是不是以自由能排序的结构为准?
还有一个问题是在计算高精度单点能进行结构排序的时候需不需要加上溶剂模型,需要的话是加SMD溶剂模型吗?

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发表于 Post on 2024-7-26 04:05:41 | 只看该作者 Only view this author
那叫6-311+G(2d,p)

用电子能量排序没自由能排序有意义。当电子能量差较小,热力学校正量的差异的可能影响排序的时候,显然光靠电子能量排序就不可靠。

只要是研究溶剂环境下的能量问题的情况,必须考虑溶剂效应,哪怕是非极性溶剂。一般用SMD
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