提问关于寻找过渡态的一些疑问

liyuqing · 发表于 Post on 2024-7-27 10:21:40

本帖最后由 liyuqing 于 2024-7-27 10:26 编辑

我在寻找两个分子的过渡态的时候，由于分子比较大，我就取了典型的局部片段，找到了过渡态
我想问这样我在找完整分子的过渡态也是和这类似的吗，吉布斯自由能垒也差不多嘛

AlexShan_UCLA · 发表于 Post on 2024-7-27 12:16:17

本帖最后由 AlexShan_UCLA 于 2024-7-27 12:17 编辑

这是常用的寻找过渡态的手段。先对反应活性中心找到过渡态，然后开始加取代基，将反应中心冻住做限制性优化，然后再全放开优化找过渡态。如此反复直到找到整个大分子的过渡态。
至于完整分子的过渡态是否和这个类似，以及吉布斯能垒是否差不多，这个很难预测。很多取代基对于电子结构以及空间作用都有很强的影响。

sobereva · 发表于 Post on 2024-7-28 07:50:51

用局部片段找过渡态只是一个中间环节中的技巧，最终必须拿完整体系找到的过渡态说事

参考北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）的ppt：

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