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[Gaussian/gview] win下可以运行的gif文件在ubuntu的gaussian下无法运行?

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本帖最后由 ngaoo 于 2024-8-16 15:51 编辑

老师,这是我的GJF文件,这个文件在win下的gaussian16中可以运行,为了让计算效率更快,我将gjf文件在ubuntu的Gaussian16(Revision C.01)下运行,出现如下报错
报错:
这是因为什么?
gjf文件: 24-7-10.gjf (4.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)
out文件: 2.out (42.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)



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发表于 Post on 2024-8-16 14:44:58 | 只看该作者 Only view this author
盲猜可能是因为 Windows 系统的文本文件每行结尾的换行符和 Linux 系统的文件每行结尾换行符不同造成的。

检查方法,Ubuntu 命令行
  1. vi -b 24-7-10.gjf
复制代码

如果看到文件每行结尾有特殊符号,就说明应该是这个问题。

解决方法,Ubuntu 命令行安装 dos2unix
  1. sudo apt install -y dos2unix
复制代码


然后,在 Ubuntu 命令行运行
  1. dos2unix 24-7-10.gjf
复制代码

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-16 15:49:02 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2024-8-16 14:44
盲猜可能是因为 Windows 系统的文本文件每行结尾的换行符和 Linux 系统的文件每行结尾换行符不同造成的。
...

谢谢大佬,我刚才转换了下,然后还是那个报错,我之前用在win下生成的gjf在ubuntu中也可以正常运行。
我这个基组用了混合基组,会不会是这里出了问题呢

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发表于 Post on 2024-8-16 15:54:58 | 只看该作者 Only view this author
你chk路径最后有个斜线/写成反斜线\了。

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5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-16 15:56:30 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2024-8-16 15:54
你chk路径最后有个斜线/写成反斜线\了。

这个我在其他的gjf文件下试运行了,没有影响,谢谢你提出的问题

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6#
发表于 Post on 2024-8-16 16:30:13 | 只看该作者 Only view this author
实测你的文件在上传到Linux系统之后最后一行的空行消失了,导致Gaussian认为你的输入文件没有结束而报错,在文件最后多加几行空行就可以正常运行了

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7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-16 17:18:28 | 只看该作者 Only view this author
Dempey 发表于 2024-8-16 16:30
实测你的文件在上传到Linux系统之后最后一行的空行消失了,导致Gaussian认为你的输入文件没有结束而报错, ...

大佬,您太好了!!!!还替我实测!!!!太感谢您了

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