求助：有关库伦（静电）作用强度的表征

藤井树 · 发表于 Post on 2024-8-18 21:55:51

老师们好，我用Gromacs软件模拟了主客体的小分子纯有机体系，奇怪的是在运用其能量分解分析表征库伦作用时，原本纯主体体系中比较强的库伦吸引作用在主客体掺杂体系中居然变成了排斥作用，请教有没有适合表征这个过程中库伦作用转换的方法？

sobereva · 发表于 Post on 2024-8-18 22:21:59

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

交代清楚细节

藤井树 · 发表于 Post on 2024-8-19 08:25:18

sobereva 发表于 2024-8-18 22:21
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

sob老师好，我MD模拟了三个体系分别是纯客体，纯主体，主客体掺杂体系，进行gmx energy提取体系内的库伦作用，发现有较大差别。
1. 纯客体体系内存在较大的短程库伦排斥作用
2. 纯主体体系内存在较大的短程库伦吸引作用
3. 主客体掺杂体系中模拟初期主客体间存在弱短程库伦吸引作用，后突变为短程库伦排斥作用
想探究一下其中的原因。

sobereva · 发表于 Post on 2024-8-19 11:00:26

藤井树发表于 2024-8-19 08:25
sob老师好，我MD模拟了三个体系分别是纯客体，纯主体，主客体掺杂体系，进行gmx energy提取体系内的库伦 ...

直接给出结构图，上传mdp文件，说清楚具体数值

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[综合交流] 求助：有关库伦（静电）作用强度的表征