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[综合交流] 计算RESP2电荷,对得到的真空下的分子chk文件进行freqchk时要求内存太大

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我刚学gromacs不久,比较菜,今天在做模拟时,学习计算RESP2电荷,对DME_gas.chk进行freqchk操作时系统报错并要求2000,000MW以上的空间,谷歌搜了一圈没找到答案,请问一下各位老师这是什么原因,是我文件写错了还是配置不行,希望能得到老师的解答,生成chk文件的gjf文件如下所示:

%chk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME.chk
%mem=16GB
%nprocs=12
# opt freq b3lyp/TZVP em=GD3BJ

DME

0 1
C                 -0.33003282    0.80841577   -0.00000172
H                  0.02676818    1.31276749    0.87362428
H                  0.02672853    1.31270774   -0.87367840
C                 -1.87003278    0.80876540    0.00003322
H                 -2.22683378    0.30441367   -0.87359278
H                 -2.22679412    0.30447342    0.87370991
O                  0.14632775   -0.53990934    0.00003358
O                 -2.34639334    2.15709051   -0.00000207
C                  1.57632771   -0.54023400    0.00000113
H                  1.93276534   -1.54912062    0.00002754
H                  1.93308906   -0.03594202   -0.87367555
H                  1.93312871   -0.03588228    0.87362713
C                 -3.77639331    2.15741516    0.00003038
H                 -4.13315465    1.65312319    0.87370706
H                 -4.13283093    3.16630179    0.00000397
H                 -4.13319431    1.65306344   -0.87359562

--link1--
%mem=16GB
%nprocs=12
%oldchk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME.chk
%chk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME_gas.chk
# b3lyp/Def2TZVP em=GD3BJ geom=allcheck


--link1--
%mem=16GB
%nprocs=12
%oldchk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME.chk
%chk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME_solv.chk
# b3lyp/Def2TZVP em=GD3BJ scrf(read,SMD,solvent=1,1,2-TriChloroEthane) geom=allcheck

eps=7.1937
epsinf=2.1641


能用gaussian16正常运行并生成3个chk文件,对DME.chk进行freq操作可以正常执行,但DME_gas.chk和DME_solv.chk就会出错,报错情况如图:


QQ截图20240821194239.png (37.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

蓝圈中即为报错信息

蓝圈中即为报错信息

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-21 20:09:49 | 只看该作者 Only view this author
内置溶剂没有找到DME,用的1,1,2-TriChloroEthane代替,eps和epsinf都相近

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发表于 Post on 2024-8-22 01:06:37 | 只看该作者 Only view this author
szg 发表于 2024-8-21 20:09
内置溶剂没有找到DME,用的1,1,2-TriChloroEthane代替,eps和epsinf都相近

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了,以后注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2024-8-22 01:08:03 | 只看该作者 Only view this author
分清楚formchk和freqchk,完全是两码事。下文根本就没提到freqchk的事

RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-22 09:13:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-22 01:08
分清楚formchk和freqchk,完全是两码事。下文根本就没提到freqchk的事

RESP2原子电荷的思想以及在Multiw ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-22 09:14:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-22 01:06
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

ok,以后一定注意

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