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楼主 Author: liyuanhe211
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[Gaussian/gview] Gaussian 常见报错及解决方法;新手求助报错时的注意事项

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-24 23:23:35 | 只看该作者 Only view this author
15536365262 发表于 2021-11-24 16:16
IOp(3/59)可能可以控制检查基组线性相关问题的阈值,可将其放宽尝试,这个具体怎么实施呢?

加上IOp(3/59=XXXXX) 关键字来改变相应选项。想改成什么看IOp手册。如果不理解手册说的什么意思,就不要乱用IOp。

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发表于 Post on 2021-12-23 13:36:56 | 只看该作者 Only view this author
“此时梯度计算所需的时间显然不可忽略;对没有解析Hessian的方法,计算一次频率的耗时为6N次[单点+频率]”
写错了吧,应该是“6N次[单点+梯度]”吧?
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-12-23 14:09:39 | 只看该作者 Only view this author
另外您认为扫描过程中遇到跃变是不正常的,实际上我经常看到这种情况,我认为这是正常现象,可以取扫描最高点作为过渡态初猜,见附图。

扫描跃变.png (50.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 67)

扫描跃变.png
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-27 10:29:36 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-12-23 14:09
另外您认为扫描过程中遇到跃变是不正常的,实际上我经常看到这种情况,我认为这是正常现象,可以取扫描最高 ...

扫描中能量不连续不说明扫描不正常,但其扫出的鞍点不是好的过渡态初猜。

你的图也说明了这一点,过渡态键长处的扫描点落在了左侧的极小值附近。你扫出的极大值点离过渡态的键长比较近(自上至下第二个点)有两个因素,一是势能面过于陡峭、规整、二是过于简单只有二维、且两个维度都与反应相关,这种势能面本来就不太会出现找不到过渡态的情况。如果没有这两个因素,通常要设计一个横纵坐标同时变化的复合坐标,或者直接做二维柔性扫描效果才比较好。对于高维情况,有可能造成跃变的变量跟反应根本没关系。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-27 10:29:48 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-12-23 13:36
“此时梯度计算所需的时间显然不可忽略;对没有解析Hessian的方法,计算一次频率的耗时为6N次[单点+频率]” ...

感谢指正,已修改。

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发表于 Post on 2022-5-25 11:14:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 齐齐吃烤鱼 于 2022-5-25 11:58 编辑

老师,您好,我想问一下我用笔记本电脑运行Gaussian有点慢,我就想着找个台式(内核16,线程3471 )能运行的快一些,但是出现2070后,out文件到% nprocshared=12
will use up 12 processors via shared memeory这一步就停住了,然后我用同样的设置在笔记本上是可以运行的,老师,您知道是怎么回事吗?

微信图片_20220525115607.jpg (1.13 MB, 下载次数 Times of downloads: 81)

微信图片_20220525115607.jpg

微信图片_20220525115622.jpg (1007.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 74)

微信图片_20220525115622.jpg

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发表于 Post on 2022-5-29 14:29:45 | 只看该作者 Only view this author
齐齐吃烤鱼 发表于 2022-5-25 11:14
老师,您好,我想问一下我用笔记本电脑运行Gaussian有点慢,我就想着找个台式(内核16,线程3471 )能运行 ...

看看你的 Gaussian 09W 是不是 SMP 版的,SMP只能用单核,1.5GB内存

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发表于 Post on 2022-10-13 15:15:30 | 只看该作者 Only view this author
李老师你好,我今天遇到了如下的问题,你看需要补充到帖子中吗计算为:qst3方法寻找过渡态。


RFO step:  Lambda0=5.726152644D-02 Lambda= 3.62961408D-03.
Inconsistency:  ModMin=   2 Eigenvalue= 1.42049519D-02.
Error termination via Lnk1e in /home/ddn/software//g16/l103.exe at Thu Oct 13 14:15:41 2022.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-17 10:11:28 | 只看该作者 Only view this author
chuan437 发表于 2022-10-13 15:15
李老师你好,我今天遇到了如下的问题,你看需要补充到帖子中吗计算为:qst3方法寻找过渡态。

谢谢提供。我没有遇到过这个问题,不需保密的话可否提供一下输入文件?另外在使用QST3的前提下有无已知解决方法?

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发表于 Post on 2022-10-24 22:56:23 | 只看该作者 Only view this author
李老师,这几天没上论坛,刚看到。
文件倒是并不保密,但是我找了一下并没有找到,可能已经删掉了。
后来我该用ts方法找过渡态,就没有出现那个问题了。

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发表于 Post on 2023-1-16 17:47:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 fubingjie 于 2023-1-16 22:08 编辑

老师您好,想请问一下遇到了这个问题需要怎么解决呢?

202301161746589625..png (32.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

202301161746589625..png

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发表于 Post on 2023-1-16 17:50:30 | 只看该作者 Only view this author
fubingjie 发表于 2023-1-16 10:47
?老师您好,想请问一下遇到了这个问题需要怎么解决呢?

上传完整的输入文件
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-1-16 21:18:17 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-1-16 17:50
上传完整的输入文件

已在原贴上传,麻烦老师了!

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发表于 Post on 2023-1-16 21:42:41 | 只看该作者 Only view this author
fubingjie 发表于 2023-1-16 10:47
老师您好,想请问一下遇到了这个问题需要怎么解决呢?

这个输入文件的问题极其多。
(1)genecp对应的基组和赝势要写在坐标后面,而不是坐标前面。仔细反复阅读http://sobereva.com/60
(2)那个基组叫6-31G不叫b-31G
(3)6-31G的计算结果是不能发表的,必须加极化函数。仔细阅读http://sobereva.com/336了解为什么必须加极化函数、怎么加极化函数以及加多少
(4)你给P自定义的基组只有d函数,没有s、p函数。仔细阅读http://sobereva.com/60了解怎么加s、p函数
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-1-16 21:44:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-1-16 21:42
这个输入文件的问题极其多。
(1)genecp对应的基组和赝势要写在坐标后面,而不是坐标前面。仔细反复阅 ...

好的,谢谢老师,刚刚开始入门,麻烦老师了!

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