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[GROMACS] 如何选择正确的pull code 类型

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楼主

发表于 Post on 2024-9-20 21:36:07 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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这个图是pull code功能的示意图，虚拟弹簧头部以vs的速度恒速移动,蛋白质的末端部分C-a原子固定，头部部分C-a原子作为牵引组，这里的ks应该是pull-coord1-k，如何求出P所受灰色弹簧的力，这里的P在弹簧的牵引下可以视作匀速吗？如何选择正确的pull-coord1-type。

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