学校超算上安装orca计算报错，找不到libmpi.so.40，求助解决方案

wayneLiu · 发表于 Post on 2024-9-20 22:51:59

之前安装orca都是在本地服务器上安装使用，因此没有遇到什么安装的问题，但是这次在新服务器上安装orca时遇到了。。。具体如下：
学校超算上的软件环境为：
1、操作系统：Rocky Linux 8.6
2、编译器：GCC/Intel
--gcc version 8.5.0
--Intel oneAPI 2023（包含Intel MPI），modulefiles路径：/share/opt/moduledeps
3、调度软件：Slurm

无法使用root权限。
按照sob老师的教程安装后，计算后报错（图1和图2），.bashrc信息（图3），ps：超算上已经安装fortran

乐平 · 发表于 Post on 2024-9-20 23:11:46

本帖最后由乐平于 2024-9-20 23:14 编辑

大概率你没有在超算上 module load gcc 9 或者更高的版本

另外，没必要在 ~/.bashrc 里写 module load XXX，直接在命令行里 module load XXX 就行了。
即使以后在提交任务时需要调用 XXX 编译环境，也只用在提交任务的脚本里写 module load XXX，而不用在 ~/.bashrc 里写 module load XXX

wayneLiu · 发表于 Post on 2024-9-20 23:25:46

乐平发表于 2024-9-20 23:11
大概率你没有在超算上 module load gcc 9 或者更高的版本

另外，没必要在 ~/.bashrc 里写 module load X ...

[lxy1syz2lb@manage1 ORCATEST]$ module avail
----------------------------------- /share/opt/moduledeps ------------------------------------
intel/2023.2.0  sharemdf

------------------------------- /usr/share/Modules/modulefiles -------------------------------
dot  module-git  module-info  modules  null  use.own

-------------------------------- /share/software/modulefiles ---------------------------------
go-1.21.4  singularity-3.8.7

Key:
loaded  modulepath
[lxy1syz2lb@manage1 ORCATEST]$
好像没有gcc....

abin · 发表于 Post on 2024-9-21 10:24:44

平台上有apptainer/singularity的话,
可以用这个, 下载就能用.

https://pan.baidu.com/s/18Q1hcop9JvNVEra8NVCULg?pwd=m9jm

相关介绍可以查阅: https://gitee.com/hpc4you/apps

wayneLiu · 发表于 Post on 2024-9-21 11:22:09

abin 发表于 2024-9-21 10:24
平台上有apptainer/singularity的话,
可以用这个, 下载就能用.

我看到了，多谢大佬，我研究一下

wayneLiu · 发表于 Post on 2024-9-21 18:00:47

abin 发表于 2024-9-21 10:24
平台上有apptainer/singularity的话,
可以用这个, 下载就能用.

老师您好，请问这个有orca6的吗，5.4版本跟6有些部分不太兼容

xxqcn · 发表于 Post on 2024-10-30 10:57:01

MPI的问题吧.

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