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[GROMACS] 如何求出每个原子在各方向上的力

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为了计算原子受到的电场力,模拟两次,一次带电场一次不带电场,设置nstfout通过gmxdump -f all.trr |grep "f.  977" > force.txt 导出每个原子的受力,将两次force.txt里的原子受力相减 是不是就是每个原子受到的电场力。gmx dump可以导出原子每一帧的X Y Z方向上的力,两次相减就是每个原子在各方向上受到的电场力,这样子可以吗

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发表于 Post on 2024-9-21 23:16:03 | 只看该作者 Only view this author
根据F=Eq,直接根据电场矢量E和原子电荷q就知道电场力了,根本不用这么麻烦
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-22 15:01:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-21 23:16
根据F=Eq,直接根据电场矢量E和原子电荷q就知道电场力了,根本不用这么麻烦

是的我搞错了,因为电场力是单方向的

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