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[ORCA] 求助用ORCA如何进行键能计算

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楼主
我想用ORCA对环丙沙星分子每一个键的键能进行计算,我查阅资料发现可以通过拆分两个片段进行计算,但是在环丙沙星分子里部分结构是带环的,断开键后并不会形成两个分子片段,这该如何处理?有没有什么更方便的方法可以让系统自己逐一断开键并自动进行计算两个原子之间的键能?

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发表于 Post on 2024-9-22 16:59:50 | 只看该作者 Only view this author
应当首先重新评估一下“计算每一根键的键能”有没有必要。不能用计算键能的方法来判断哪根键容易断
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-22 17:07:36 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-9-22 16:59
应当首先重新评估一下“计算每一根键的键能”有没有必要。不能用计算键能的方法来判断哪根键容易断

那请问有什么方式可以通过计算评估哪根键容易断呢,对于计算化学真的是才接触,很多都不懂

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发表于 Post on 2024-9-22 19:12:44 | 只看该作者 Only view this author
lingchen 发表于 2024-9-22 10:07
那请问有什么方式可以通过计算评估哪根键容易断呢,对于计算化学真的是才接触,很多都不懂

把每根键断裂的反应机理画出来,然后算活化自由能
注意反应机理往往不是这根键直接断裂,可能会涉及额外的比如说水分子或者氧气分子。很多键直接断极其难断,但很容易水解或氧化断裂
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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