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[CP2K] AIMD如何指定初始温度

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楼主
本帖最后由 wmy 于 2024-9-27 19:39 编辑

各位老师好,最近准备做变温的AIMD,我想要重点考察变温过程中结构的变化(我有100 K和300 K单晶结构,空间群没有变化,只有键长微小的变化,我想动态的实现变化的过程)。对于设置参数有些疑问,请教下大家:
1. MD部分的 TEMPERATURE。我想问下TEMPERATURE是最终温度还是初始温度呢?我想从100 K变化到300 K,是否有类似vasp中的 TEBEG/TEEND参数指定变化的起始温度呢?
2. 热浴中TIMECON  调控温度波动的,越大温度波动越慢吗?
4. 假如上面的方法都无法让温度缓慢变化,我该设置那些参数呢?

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发表于 Post on 2024-9-27 18:29:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2024-9-27 18:41 编辑

看来CP2K的手册对AIMD的温度控制写得不够直观啊,我都看到至少一个两个三个四个相关讨论帖了(笑)最好都点进去读一读。

虽然自己暂时不涉及变温的研究,不知道楼主这样的计划怎么实现,但是我是这么理解温度控制的:目前CP2K尚未支持设置初始温度实现线性升温/退火的功能,&MD下&TEMPERATURE就是唯一的最终目标的平衡温度(虽然平衡时候围绕设定值仍有一定波动)。那个&ANNEALING的名字也很有误导性,手册说实际上是速度调节的因子,只用于对粒子不施加热浴的系综,不适合考察特定平衡温度下体系性质的研究。至于&TIMECON,不同热浴的时间常数具体定义不同,就目前比较推荐的CSVR而言从手册可见越小控温效果越强;一般从初始结构(如几何优化获得的)开始的预平衡阶段用小一点的值以快速接近平衡温度,平衡后(判断依据参考社长博文)收集数据的产生阶段用大一点的值以减小温控的外加影响。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-27 19:26:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wmy 于 2024-9-27 19:27 编辑
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2024-9-27 18:29
看来CP2K的手册对AIMD的温度控制写得不够直观啊,我都看到至少一个两个三个四个相关讨论帖了(笑)最好都点 ...

假如我想实现从初始温度100 K开始,我是不是只能按照参考书P230例子来实现: 1. 先设定TEMPERATURE为100,TIMECON 设为50快速拉到指定温度。 2. 然后将restart改为inp,调 温度为300 K ,TIMECON设为800,就能实现从100 K 到 300 K的缓慢温度变化下的动力学呢?
有没有更快的方法呢?

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发表于 Post on 2024-9-28 00:01:23 | 只看该作者 Only view this author
1 最终温度
2 越大温度整体变化越慢。了解热浴的基本原理

不要说什么“参考书P230”,没人知道指什么。如果是北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)的讲义(根据你的描述应当是这样),明确说出来


没有更快的方法,这就够简单的了,还怎么更快?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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