求助 gmx-plumed运行不了tpr文件

watermelon_ · 发表于 Post on 2024-9-27 17:59:31

运行 [size=0.9]gmx mdrun -s topolA.tpr -nsteps 10000000报错

tpr文件是plumed元动力学教程里自带的（教程网址https://www.plumed-tutorials.org ... a/INSTRUCTIONS.html）
怎么办呀~

lucky1999 · 发表于 Post on 2024-9-27 18:27:43

报错信息已经说的很清楚了，plumed教程中自带的tpr文件中邻居列表的生成方式是group，然而该种邻居列表的生成方式从2020版开始不再支持。

FrancisCho · 发表于 Post on 2024-9-28 08:50:48

跑PLUMED元动力学教程示例我都是用自己电脑虚拟机上的gmx2018去跑的，而且示例中的体系很简单，自己电脑就能够跑得动

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[GROMACS] 求助 gmx-plumed运行不了tpr文件