请教碳管在有机溶剂中的模拟为什么出现真空区？

yaoyuan0711 · 发表于 Post on 2024-10-15 10:31:02

本帖最后由 yaoyuan0711 于 2024-10-15 10:33 编辑

请教各位老师，在预平衡过程（100ps从0到298K，再稳定200ps），碳管在有机溶剂二氯甲烷（还有重氮甲烷）中的模拟为什么y方向（垂直碳管的方向）出现真空区？附件有输入文件，Density, Volume, Temperture都达到平衡了。

Seyilaxa · 发表于 Post on 2024-10-15 18:52:43

CNT的拓扑文件是用什么方法构建的，看看L-J势的参数是否合理

yaoyuan0711 · 发表于 Post on 2024-10-16 08:34:35

Seyilaxa 发表于 2024-10-15 18:52
CNT的拓扑文件是用什么方法构建的，看看L-J势的参数是否合理

用sobtop手动指定的ca类型原子，http://sobereva.com/soft/Sobtop/#ex7

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-17 09:57:26

如果你的碳管是周期性的，绝对不能用isotropic，否则各个方向尺寸严格同步变化，而碳管长度又不变，垂直于碳管的方向的盒子尺寸根本没法如实地调节

改了这个之后如果还有此问题，用更低温度模拟再试

yaoyuan0711 · 发表于 Post on 2024-11-4 16:53:08

sobereva 发表于 2024-10-17 09:57
如果你的碳管是周期性的，绝对不能用isotropic，否则各个方向尺寸严格同步变化，而碳管长度又不变，垂直于 ...

确实是控压的问题，谢谢sob老师

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