计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 62|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 请教一下活性物质与DES团簇的Hirshfeld surface分析问题

[复制链接 Copy URL]

3

帖子

0

威望

97

eV
积分
100

Level 2 能力者

如图,是活性物质与DES团簇的Hirshfeld surface分析,我想请问一下这种团簇是如何构建的?是需要在molclus上搜索构象,然后优化到最优结构再Hirshfeld surface分析。还是可以直接用packmol创建活性物质与DES的盒子直接Hirshfeld surface分析就可以了?

屏幕截图 2024-10-23 124802.png (453.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

屏幕截图 2024-10-23 124802.png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-10-23 13:15:24 | 只看该作者 Only view this author
显然不能直接用packmol创建的结构,根本没有物理意义,完全没有考虑分子间相互作用对结构的影响
需要用molclus做构型搜索,或者跑液相的动力学然后抠出来一个簇,再用Multiwfn做Hirshfeld surface分析


DES这种不是众所周知的词不要不给出全称上来就用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

97

eV
积分
100

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-23 14:31:13 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 10:57 , Processed in 0.202747 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list