求助dssp分析片段的二级结构出现问题

群山行云

使用2024.03版本Gromacs，文档表明该版本已经支持-n index.ndx参数

已经建立了局部片段的index，但使用该参数后发现没有出现选择index的步骤，直接开始计算

最终的num.xvg与不带-n参数的完整序列的结果完全一样

群山行云

我创建index的指令是：
gmx make_ndx -f md.gro
然后
r 202-223
q
之前分析RMSD时加-n参数可以出现[选择组]的步骤
但是在DSSP指令中没有出现该步骤

sobereva

不要自己在标题里手写【求助】这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了，以后注意

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。