Gaussian#p 计算后gview-Results-PCM solvation cavity显示灰色

hefnagxiaoji

Gaussian版本为G16
已经使用B3LYP/6-31G*对体系进行过几何优化，使用优化后结构进行单点计算。计算输入文件如下：
#P M052X/6-31G* scrf=SMD

Title Card Required

0,1
H     -4.070701919    -2.087845612    -0.022744915
C     -0.885057444     1.320945176     0.011495858
O      4.307758056     1.787075010     0.501255213
S      4.270038863     0.400642339     0.040016950
C     -3.884762135    -1.018964663    -0.014324835
O      5.096210652    -0.641113255     0.628673123
H     -5.475475345     1.989466608     0.002758185
C     -4.930039044    -0.099210126    -0.010948971
C      1.541391382     0.762322152     0.029286750
C     -4.658015583     1.274025269    -0.000164823
O     -0.638253442     2.520623111     0.012582721
C      2.571130237    -0.171764370     0.029569085
C      1.001115817    -1.990961788     0.012053415
H      0.763483314    -3.049337614     0.011234006
C     -2.283771323     0.808879338     0.004297484
H     -5.958478543    -0.449035819    -0.016560352
C     -1.459941064    -1.580390172    -0.009744882
H      1.739931472     1.828181304     0.053947387
O      4.612312844     0.428183703    -1.570729465
H      4.732155836     1.365539463    -1.815669034
H     -3.105428394     2.785082045     0.015279142
C      0.217495771     0.311103620     0.013841652
O     -1.689285187    -2.783564189    -0.022174445
C     -2.557562015    -0.574001623    -0.006434120
C     -0.052955164    -1.069487335     0.003428586
C     -3.341033807     1.726034891     0.007009080
H      3.146339428    -2.250155860     0.050473191
C      2.319396739    -1.548671601     0.027594015



计算后的输出文件见附件中所示。看了之前有关PCM 显示灰色的帖子，gview6.0.16通过File-open-选中这个out文件，勾选Read inermediate Geometries。gview显示结果如附图所示。
我看卢天老师当时上课的计算样例ethanol_water_#P中，使用的是“#P M052X/6-31G* SCRF=SMD”和我计算的基本上没有区别，并且都用的是进行过几何优化后的结构。但是这个结构就在gview中能观看PCM solvation cavity。
请问，我这个计算结果为什么看不了PCM solvation cavity呢？

sobereva

跟Gaussian版本有关

hefnagxiaoji

sobereva 发表于 2024-10-28 15:51
跟Gaussian版本有关

卢老师您好
1.所以在这里我需要在更新gview的版本吗？g16的版本已经固定了吧，还是说我需要使用其他版本的Gaussian来运行一遍再观看结果呢？
2.同样在超算linux系统的g16跑出来的结果，也是无法观看PCM solvation cavity的。

paramecium86

GV里能不能看到PCM solvation cavity主要是看输出文件里是否输出了  Spheres list 开头的一段。
根据我的经验来看。无论是A03还是C01版本的Gaussian16,
1. 当分子内的原子数小于20的时候默认会输出Sphere list 这部分。
2. 但是当分子多余20个原子。那就默认不输出。就看不到PCM solvation cavity。
想看到的话要按照官方说明书的写法用scrf(read,smd)  并且在输入文件末尾的额外溶剂信息部分加上  PrintSpheres 关键词。

hefnagxiaoji

paramecium86 发表于 2024-10-28 18:30
GV里能不能看到PCM solvation cavity主要是看输出文件里是否输出了  Spheres list 开头的一段。
根据我的 ...

已解决，非常有经验的建议，谢谢。