求助晶体分子截断补充完整后仍有原子未被补充问题

cabbage · 发表于 Post on 2024-10-31 09:39:00

本帖最后由 cabbage 于 2024-10-31 11:09 编辑

各位老师好，在读过sob老师写的“Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍”一博文后，了解到可以通过Multiwfn主功能300-7-20将被截断的分子保持完整，但是我将cif文件进行此操作后，发现仍有部分原子散落在外未构成完整分子（如图红框部分），请问这个如何解决。感谢大家不吝赐教。

4104315-br.cif (81.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-31 16:43:50

一些H有关的键太长，导致multiwfn默认设置下没判断出来相应的键
主功能0里加大bonding threshold，确保看到的键都没问题，再用那个功能

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[波函数分析求助] 求助晶体分子截断补充完整后仍有原子未被补充问题