BOMD输入文件请教

a-Student · 发表于 Post on 2024-11-1 15:25:53

本帖最后由 a-Student 于 2024-11-3 07:48 编辑

老师打扰您一下，如图1利用gaussain计算BOMD看下分析分子动力学过程，输入文件想跑700个点，步长为0.5fs，但是文件报错输入不对，关于BOMD输入讨论比较少没有找到怎样更正，所以想请教下老师，我知道ORCA比较方便，但是想尝试下gaussian，麻烦请老师指点下，谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2024-11-1 19:04:56

北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）极为全面讲了Gaussian的BOMD的用法并给了各种例子，其中最简单的一个例子：

JCenter · 发表于 Post on 2024-11-2 00:06:10

sobereva 发表于 2024-11-1 19:04
北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）极为全面讲了Gaussian ...

老师，高级量化班的内容中后续还会增加机器学习以及polyrate计算反应速率的内容吗

yflchx · 发表于 Post on 2024-11-2 09:50:16

StepSize=n
Sets the dynamic step size to n*0.0001, in the appropriate units.

自学要先仔细看手册，看程序自带的示例、测试的输入文件。

嘤嘤嘤 · 发表于 Post on 2024-11-4 11:15:05

老师，我按照这个输入应用到我的结构，可是运行几秒后就报错，网上搜了一下解决办法，但是仍旧没有解决，请问如何解决啊？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-11-4 11:38:35

嘤嘤嘤发表于 2024-11-4 04:15
老师，我按照这个输入应用到我的结构，可是运行几秒后就报错，网上搜了一下解决办法，但是仍旧没有解决，请 ...

注意空行的数目

嘤嘤嘤 · 发表于 Post on 2024-11-4 14:14:08

wzkchem5 发表于 2024-11-4 11:38
注意空行的数目

老师，您说的是末位空行吗？我空了

sobereva · 发表于 Post on 2024-11-5 02:00:09

嘤嘤嘤发表于 2024-11-4 11:15
老师，我按照这个输入应用到我的结构，可是运行几秒后就报错，网上搜了一下解决办法，但是仍旧没有解决，请 ...

北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）里这页ppt专门强调了用genecp时的格式：

另外，强烈不建议用又慢势能面又往往不光滑的M06-2X做AIMD。不想用B3LYP-D3(BJ)、PBE0-D3(BJ)的话用wB97XD都好得多。当前带弥散又没必要又令耗时暴增又自找麻烦。嫌6-311G**不够的话用def-TZVP是比加弥散好得多得多的做法

嘤嘤嘤 · 发表于 Post on 2024-11-5 14:03:54

sobereva 发表于 2024-11-5 02:00
北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）里这页ppt专门强调了 ...

好的，谢谢老师。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Gaussian/gview] BOMD输入文件请教