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[波函数分析求助] 求助利用VESTA或VMD绘制局部电子密度差图

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我用CP2K计算后产生的cube文件,经过处理得到的电子密度差使用VESTA作图结果如下

我想请问一下,如果只想看其中一层结构中的电子密度差,应该如何处理?或者用VMD是否可以实现这个目的?

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发表于 Post on 2024-11-9 08:07:09 | 只看该作者 Only view this author
如果只想在当前这副图上抹掉其它层的等值面,自己ps就完了,把显示和不显示等值面的图作为两个图层,并且抹掉一部分透出另一层即可

如果从格点数据层面进行处理,用Multiwfn主功能13提供的格点数据屏蔽功能,把距离某一层原子较远的格点的数值都设为0,参考Multiwfn手册4.13.4节的例子
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-9 11:00:55 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师,听了您的建议,用Multiwfn把问题解决了。

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