求助将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法

Joycelv · 发表于 Post on 2024-11-7 10:28:45

老师您好，我在用GROMACS模拟分子聚集后，想看分子在聚集态下的电荷分布，按照您在《将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法》文中的步骤，我先将分子的gro和xtc文件导入VMD，然后将charge.txt导入到VMD后，VMD就卡死了，由于gro和xtc文件中已经去掉水分子了，所以我后来尝试把charge.txt中的水分子电荷信息也去掉了，但是也是同样的结果。是因为我的分子太大了吗，请问有什么解决办法吗？另外，我是想看分子聚集对分子静电势的影响，不知道这样做是否合理，谢谢老师啦

sobereva · 发表于 Post on 2024-11-7 12:18:24

帖子标题不得乱用叹号，置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。这次给你改了，下次乱用叹号直接删帖扣分处理。

每次引用我博文时应当自觉给出文章链接，给你加上了

论坛里所有新帖我全都看得到，不要at我，给你去掉了

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[VMD] 求助将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法