Gaussian结合Gromacs进行QM/MM计算

Yoghurt · 发表于 Post on 2017-1-21 20:01:25

请问，QM/MM方法是不是只要有一个量化软件和一个分子动力学的软件结合就可以？能用Gaussian结合Gromacs的QM/MM方法来计算分子体系的光吸收和激发态优化计算吗？谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2017-1-21 21:55:31

没那么简单。要么量化程序或者分子动力学程序其一留出接口给对方，要么就得用第三方的界面程序如pupil、chemshell将QM和MD程序连接在一起才能做QM/MM的MD。

对于你当前的目的，直接用Gaussian做ONIOM就完了，比较省事。

用GROMACS+Gaussian需要鼓捣，见
http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/QMMM

小范范1989 · 发表于 Post on 2017-1-22 09:02:52

我智慧与美貌并存，英雄与侠义化身的富态师姐，终于浮出水面了。
那么问题来了，为什么会上浮呢？是收到的浮力增加了还是水的密度有变化呢？

三石草祭 · 发表于 Post on 2017-1-22 09:59:33

小范范1989 发表于 2017-1-22 09:02
我智慧与美貌并存，英雄与侠义化身的富态师姐，终于浮出水面了。
那么问题来了，为什么会上浮呢？是收到的 ...

师姐一直算水溶液下的，下载要算密度更大的，所以浮上来了

greatzdk · 发表于 Post on 2017-1-26 08:53:07

不能并行，只能一个核

Lvk · 发表于 Post on 2023-10-17 15:11:53

sobereva 发表于 2017-1-21 21:55
没那么简单。要么量化程序或者分子动力学程序其一留出接口给对方，要么就得用第三方的界面程序如pupil、che ...

呜呜呜这链接挂了，请问您还有教程吗？

Jeffrey0521 · 发表于 Post on 2023-11-23 08:53:09

Lvk 发表于 2023-10-17 15:11
呜呜呜这链接挂了，请问您还有教程吗？

同求，想问找到教程了吗？

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] Gaussian结合Gromacs进行QM/MM计算

浏览过的版块