Gaussian理论计算的环加成反应选择性与实验不符合

Chemy · 发表于 Post on 2024-11-9 09:14:22

各位老师好，我最近在计算一个环加成反应的面选择性和endo-exo选择性。想利用优化出来不同构型的过渡态能垒大小的比较来判断反应选择性，可是发现得到的结果是与实验结果相反的。实验数据仅得到了exo产物，而在计算中却发现形成exo过渡态的能垒高endo过渡态～8 kcal/mol。（M062X-D3/Def2-TZVP//B3LYP-D3(BJ)/6-31G(d,p)），不知道遇到这种理论计算和实验事实相反的时候应该如何处理？
以下是我的一些想法：
1）过渡态结构不是最优结构
2）反应机理还有其他可能的路径

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-11-9 09:39:42

有没有做构象搜索？溶剂效应是如何考虑的？底物上有没有酸性或碱性基团，有没有可能实际质子化状态和你画的不符？

Chemy · 发表于 Post on 2024-11-9 09:57:17

wzkchem5 发表于 2024-11-9 09:39
有没有做构象搜索？溶剂效应是如何考虑的？底物上有没有酸性或碱性基团，有没有可能实际质子化状态和你画的 ...

感谢回复，1）对结构做过取代基的二面角柔性扫描，找的能量最低点优化的结构；2）目前猜测的机理有氢键活化作用，我在计算单电能的时候考虑了SMD隐形溶剂效应，但是结构优化没有考虑；3）底物有酸性基团，质子化状态确实还有其他可能

ionexchangeC · 发表于 Post on 2024-11-9 19:36:39

8 kcal/mol的活化自由能差太大了，我之前计算过一个类似的体系能垒差不到1 kcal/mol

KAIMISITERUI · 发表于 Post on 2024-11-10 15:24:29

有没有可能反应选择性是热力学控制的，不过8kcal确实差的有些大了，应该根据实验结果想想其他可能的机理

287192454 · 发表于 Post on 2024-11-10 15:39:05

8 kcal/mol的能垒差啊！在反应温度下计算能垒差应该会把差距缩小很多吧？

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[综合交流] Gaussian理论计算的环加成反应选择性与实验不符合