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[Gaussian/gview] 团簇模型计算COF吸附多硫化锂,固定吸附位点多远的原子合理?

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本帖最后由 lexin 于 2024-11-16 16:48 编辑

建立了一个COF吸附多硫化锂的模型,由于COF比较大,只截取了吸附位点周围的一部分,优化复合结构的时候固定距离吸附分子7埃左右的原子合理吗。具体结构不太方便发出来。

202411161647343201..jpg (137.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202411161647343201..jpg

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发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
提问格式不符合论坛要求,按http://sobereva.com/620补全所有背景信息后我们再回答
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发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
认真看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,重新修改帖子标题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-16 13:33
认真看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,重新修改帖子标题

好的,sob老师

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发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
不要发别人必须歪着脖子才能看的图

图上标的7埃指代不明,也不知道是指的哪到哪的跨度

只能说,对于吸附后的结构中,距离被吸附分子超过7埃的COF原子都冻结的做法一般可以

但应当注意的是,如果实际中COF是一层层堆叠的,光单独拿一层COF得到的吸附后的结构和实际可能有很大差异,也很可能遭质疑。理想的做法是用CP2K程序以周期性模型(晶胞中含有多层COF)计算吸附。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-17 02:08
不要发别人必须歪着脖子才能看的图

图上标的7埃指代不明,也不知道是指的哪到哪的跨度

抱歉,提问不太熟练,谢谢sob老师

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