“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 628|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 跑NVT的时候One or more water molecules can not be settled问题求助

[复制链接 Copy URL]

32

帖子

0

威望

251

eV
积分
283

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
跑em的时候并没有这个报错,但是再跑NVT的时候跑错。附件的PULL.mdp是跑NVT的mdp文件,因为尝试了很多方法都无法解决报错,想让大家看看是拓扑文件的问题还是mdp文件设置的问题。

GO-COOH.itp

276.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

topol.top

2.93 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

PULL.mdp

699 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

em.mdp

487 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-13 11:42 , Processed in 0.227825 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list