计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 72|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Sobtop] 求助基于RESP电荷生成拓扑结构的方法

[复制链接 Copy URL]

21

帖子

0

威望

63

eV
积分
84

Level 2 能力者


使用multiwfn计算了RESP,要用sobtop生成拓扑结构,有什么捷径吗(Ubuntu系统),或者怎么快速替换掉已有itp中的电荷
请大佬赐教

23

帖子

0

威望

278

eV
积分
301

Level 3 能力者

2#
发表于 Post on yesterday 20:50 | 只看该作者 Only view this author
sobtop中可以载入chg文件,这样新产生的itp文件里就是计算好的电荷了
可以看sobtop官方的网站:http://sobereva.com/soft/Sobtop/

21

帖子

0

威望

63

eV
积分
84

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 20:52 | 只看该作者 Only view this author
Ajl 发表于 2024-11-26 20:50
sobtop中可以载入chg文件,这样新产生的itp文件里就是计算好的电荷了
可以看sobtop官方的网站:http://sob ...

很奇怪multiwfn计算的总电荷是0,但是sobtop里加载出来总电荷是-0.000000000002,请问这个正常吗

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112544

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 4 hour ago | 只看该作者 Only view this author
milk_q 发表于 2024-11-26 20:52
很奇怪multiwfn计算的总电荷是0,但是sobtop里加载出来总电荷是-0.000000000002,请问这个正常吗

显然可以忽略不计。数值计算精度问题,没法避免

网页里都写明了。认真完整看一遍再用sobtop

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 19:55 , Processed in 0.508472 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list