结构优化和频率计算报错Small interatomic distances encountered

星星到齐了吗 · 发表于 Post on yesterday 21:03

我想对这个分子进行结构和频率计算，选择的方法和基组如下，但是结果报错，想问下大家这个怎么修改吗

cokie · 发表于 Post on yesterday 21:42

你读一下报错文件中给的这句话就知道了：

Small interatomic distances encountered:42 39
Problem with the distance matrix.

42和39号原子的初始距离太近了，调整一下你输入文件中给的初始结构。

星星到齐了吗 · 发表于 Post on yesterday 21:55

cokie 发表于 2024-11-26 21:42
你读一下报错文件中给的这句话就知道了：

42和39号原子的初始距离太近了，调整一下你输入文件中给的初始 ...

那可以问一下Gaussview里面怎么看原子序号吗

pikachuupup · 发表于 Post on yesterday 21:58

星星到齐了吗发表于 2024-11-26 21:55
那可以问一下Gaussview里面怎么看原子序号吗

右键，View->Labels

星星到齐了吗 · 发表于 Post on yesterday 22:15

cokie 发表于 2024-11-26 21:42
你读一下报错文件中给的这句话就知道了：

42和39号原子的初始距离太近了，调整一下你输入文件中给的初始 ...

很奇怪我看了42号原子和39号原子，这初始距离也不近

wal · 发表于 Post on yesterday 22:27

星星到齐了吗发表于 2024-11-26 22:15
很奇怪我看了42号原子和39号原子，这初始距离也不近

这张图与你主楼给出的输出文件并不来自同一个文件
主楼45号原子是Cl 你图里变成H了

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[Gaussian/gview] 结构优化和频率计算报错Small interatomic distances encountered