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[GROMACS] 皮秒电场参数设置请教

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请教一下各位老师,如果我想设置一个频率是0.5THz,场强0.6V/NM,上升沿时间为60fs,占空比为0.5的电场,那么外电场设置为:electric-field-x = 0.6 12.57  0.06 1是否正确?

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发表于 Post on 2024-11-28 23:09:10 | 只看该作者 Only view this author
mdrun运行时加上-field选项就可以输出field.xvg文件,记录了各个时刻的电场大小信息。自己看一下便知
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发表于 Post on 2024-11-29 11:30:03 | 只看该作者 Only view this author
你这既然提到了占空比,电场形式应该就是双向脉冲电场。而gmx默认的就是正弦函数类型的波形,并不适合。并且你的周期很短,分段模拟也不合适,这种情况gmx一般只能修改源代码。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-2 15:35:44 | 只看该作者 Only view this author
lyj714 发表于 2024-11-29 11:30
你这既然提到了占空比,电场形式应该就是双向脉冲电场。而gmx默认的就是正弦函数类型的波形,并不适合。并 ...

感谢老师,事实上我想形成的是单向脉脉冲的电场,这样的话是该怎么做合适呢?

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