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[建模与可视化] PDB文件中的电荷用什么软件可以保存?

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楼主
我计算了两个分子中的原子电荷保存为PDB文件(在其最后一列加上电荷),然后用软件把两个分子复合后在保存为PDB文件时,电荷那一列没有了。用什么软件和方法可以保留电荷?

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发表于 Post on 2024-12-2 04:41:59 | 只看该作者 Only view this author
pdb格式本来就不记录原子电荷。pqr格式才专门有一列记录原子电荷

pqr格式在下文提到了
使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数
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发表于 Post on 2025-3-21 23:30:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-2 04:41
pdb格式本来就不记录原子电荷。pqr格式才专门有一列记录原子电荷

pqr格式在下文提到了

那请教sob老师 可以在pdb文件中添加电荷数据吗,vmd能识别出来吗?

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发表于 Post on 2025-3-22 15:21:14 | 只看该作者 Only view this author
xxx127 发表于 2025-3-21 23:30
那请教sob老师 可以在pdb文件中添加电荷数据吗,vmd能识别出来吗?

pdb里不记录原子电荷信息。pqr格式才记录
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发表于 Post on 2025-3-24 10:59:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-22 15:21
pdb里不记录原子电荷信息。pqr格式才记录

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