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[GROMACS] 如何将Buckingham势的参数转化为LJ的参数

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本帖最后由 ZQing 于 2024-12-2 20:12 编辑

老师好,我想要将Buckingham势的参数(A,B,C6)转化为LJ势的参数(C6,C12),有什么办法可以实现吗?
我注意到gromacs里有一个命令是
  1. gmx sigeps
复制代码
关于这个命令手册里有一句话
  1. In addition, it makes an approximation of a Buckingham potential to a Lennard-Jones potential.
复制代码
我试了一下,把文献中的Buckingham势的参数(A,B,C6)代进去
  1. gmx sigeps -A 200000 -B 34.07 -C 0.005 -o output.xvg
复制代码
但是它也不会生成具体的LJ势C6,C12值,而是产生了如下数据:
所以我想知道这个命令可以得到由Buckingham势的参数(A,B,C6)转化而来的LJ势的参数(C6,C12)吗?如果不可以那我可以通过什么方法得到呢?

我感到非常疑惑,希望有老师可以帮我解答一下,非常感谢!

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