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[VMD] 如何解决vmd中粒子种类不会随着帧数变化,始终保持初始种类的问题

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楼主
      各位老师好,我目前在lammps上做了一个粒子种类随模拟步数逐渐改变的MD模拟,想通过vmd使不同种类粒子颜色不同来观察演化,试了多种文本格式后发现粒子种类总是保持在第一帧的情况,请问这种问题怎么解决?

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傻傻的木瓜

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发表于 Post on 2024-12-3 21:05:49 | 只看该作者 Only view this author
用VMD自带topotools插件(https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/topotools/)的readlammpsdata或者readvarxyz功能载入轨迹。虽然VMD要求多帧结构/轨迹文件里各帧原子数相同,但是上述插件可以自动填补虚粒子来处理。
√546=23.36664289109

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