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[Gaussian/gview] 求助分子构型优化过程中H原子发生移动

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老师,请问我将通过两个物质中的质子转移反应合成了盐,形成盐的结构应该是羟基中的H原子失去变成O负离子,NH2接收H原子变成NH3阳离子,但是我通过使用g16优化红框中的H原子仍然会跑到O上。我是不是应该把H原子固定在N原子上呢?麻烦各位老师指导迷津。



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发表于 Post on 2024-12-5 16:38:49 | 只看该作者 Only view this author
记得带隐式溶剂模型。即便对于晶体环境下模拟,这也比在真空下计算强
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-5 17:08:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-5 16:38
记得带隐式溶剂模型。即便对于晶体环境下模拟,这也比在真空下计算强

好的老师十分感谢老师 带了隐式溶剂模型同时加了显示溶剂 H还是发生转移回到O负离子上,这样是不是可以将H固定到N上 这样对计算相互作用能是否有影响呢

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发表于 Post on 2024-12-5 19:48:46 | 只看该作者 Only view this author
jiushizhege 发表于 2024-12-5 17:08
好的老师十分感谢老师 带了隐式溶剂模型同时加了显示溶剂 H还是发生转移回到O负离子上,这样是不是可以将 ...

说明用的计算级别,以及用的什么溶剂
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-12-5 23:34:14 | 只看该作者 Only view this author
做过这个原子的扫描吗(O···H or N···H键),这个未必不是优势构象

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