GMX做动力学模拟运行前指定CPU参与数量和GPU的ID的问题请教

pkuchemistry · 发表于 Post on 2024-12-11 11:33:07

各位大佬好！

本人的服务器上有100块CPU，5块GPU, 做MD的时候使用命令 gmx mdrun -v -deffnm simulation

发现GPU被默认分配到0号GPU，全部100块CPU都参与了MD，为了避免影响其他使用者，具体怎么设置CPU的参与数量和指定GPU的ID呢？

亟需完整的命令，谢谢各位大佬~~

abin · 发表于 Post on 2024-12-11 12:58:49

使用slurm调度器管制CPU和GPU资源。

比如每一个计算，都是20core + 1 GPU，
使用调度器后，用户任务中，GPU ID会是0，因为要了一个GPU

调度器会自动调用这五个GPU给不同的作业。

pkuchemistry · 发表于 Post on 2024-12-12 10:58:42

abin 发表于 2024-12-11 12:58
使用slurm调度器管制CPU和GPU资源。

比如每一个计算，都是20core + 1 GPU，

您说的slurm调度器是怎么一回事呢？需要额外安装么，有没有更简单的在命令行设置一下呢？

abin · 发表于 Post on 2024-12-12 13:56:21

pkuchemistry 发表于 2024-12-12 10:58
您说的slurm调度器是怎么一回事呢？需要额外安装么，有没有更简单的在命令行设置一下呢？

“您说的slurm调度器是怎么一回事呢？需要额外安装么，有没有更简单的在命令行设置一下呢？”

你找个AI问问?

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