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[ORCA] 体系大概一百九十个原子,用B97-3c优化,计算速度慢,该如何提升计算速度?

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orca计算,体系大概一百九十个原子,用的B97-3c机组优化。scf已经五个多小时了,还没有输出第一帧。
体系有六个Zr,其余是碳氢氧。防止骨架坍塌,固定了几个碳原子。
想咨询一下,该如何提升计算速度

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发表于 Post on 2024-12-11 19:00:02 | 只看该作者 Only view this author
先说说你的硬件规格呀……
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发表于 Post on 2024-12-11 21:38:41 | 只看该作者 Only view this author
减小基组到double zeta。或者假如你用的是ORCA 5.0的话,更新到ORCA 6.0
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2024-12-11 21:43:21 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “计算速度慢” 改了,以后务必注意!

B97-3c叫方法不叫基组

搞清楚当前正常并行、安装没有,仔细看
量子化学程序ORCA的安装方法
http://sobereva.com/451http://bbs.keinsci.com/thread-11697-1-1.html


不说计算资源问计算速度毫无意义。倘若就是个笔记本电脑,B97-3c优化190多原子体系开玩笑
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-12 09:10:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zongshu 于 2024-12-12 09:13 编辑
abin 发表于 2024-12-11 19:00
先说说你的硬件规格呀……

计算硬件一般,Intel(R) Xeon(R) Platinum 8173M CPU @ 2.00GHz   2.00 GHz  (2 个处理器),内存176 GB

! B97-3c opt noautostart miniprint nopop slowconv SOSCF
%maxcore  3000
%pal nprocs  72 end

这是我的设置

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-12 09:15:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-11 21:43
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

并行是安装了的。谢谢老师。具体参数我已经回复了

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发表于 Post on 2024-12-12 09:34:03 | 只看该作者 Only view this author
8173M双路才56核,你为啥用72进程算呀,那肯定慢啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-12 12:42:10 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2024-12-12 09:34
8173M双路才56核,你为啥用72进程算呀,那肯定慢啊

我用的是win版,显示是112个

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发表于 Post on 2024-12-12 13:55:36 | 只看该作者 Only view this author
几个内存条?

要不你关闭超线程?
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发表于 Post on 2024-12-12 15:01:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 snljty2 于 2024-12-12 15:02 编辑
zongshu 发表于 2024-12-12 12:42
我用的是win版,显示是112个

那是逻辑核心,不是物理核心。参考卢老师博文正确认识超线程(HT)技术对计算化学运算的影响。不建议用Windows版。以及考虑上面提到的内存通道数问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-12 15:04:42 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2024-12-12 13:55
几个内存条?

要不你关闭超线程?

内存条我记得是插满了,十几根

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-13 09:12:19 | 只看该作者 Only view this author
反馈一下,请大家使用orca6.0版本以上,我更新完,速度提升了四五倍。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-13 09:15:39 | 只看该作者 Only view this author
我还想在咨询一个问题,使用orca计算我固定了部分原子,防止骨架坍塌,这样会不会影响静电势分布,lumohumo轨道。

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发表于 Post on 2024-12-13 09:31:30 | 只看该作者 Only view this author
zongshu 发表于 2024-12-13 09:15
我还想在咨询一个问题,使用orca计算我固定了部分原子,防止骨架坍塌,这样会不会影响静电势分布,lumohumo ...

看你固定的合不合理了,如果是为了保持单晶结构的骨架构象一般问题不大,如果强行维持一种不合理的构象,lumo homo会受影响

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-13 10:12:04 | 只看该作者 Only view this author
lemon_electron 发表于 2024-12-13 09:31
看你固定的合不合理了,如果是为了保持单晶结构的骨架构象一般问题不大,如果强行维持一种不合理的构象, ...

谢谢

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