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[综合交流] 求助不同金属催化cis/trans异构过程的能量分解问题

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老师,您好,我在研究不同金属催化cis/trans异构过程的,得到的计算结果是,[C,O]催化剂的能垒比[P,O]催化剂高,能量分解时【将过渡态分成了乙烯(红色)和其他部分】得到了[C,O]催化剂中催化剂部分和乙烯部分具有更大的形变,也就是该种催化剂中由于具有更大的形变导致了过高的能垒。然而对两种催化剂的包埋体积进行计算时(使用两个催化剂结构),[C,O]催化剂却有更小的数值80.2([P,O]催化剂89.8),这与能量分解的结果相反。请问老师这是什么原因导致的呢,还有就是有没有别的分析方法解释能量分解的结果呢。

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发表于 Post on 2024-12-16 03:37:33 | 只看该作者 Only view this author
反应物和产物各是什么?由你给的过渡态结构不能唯一确定这个反应是如何进行的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-16 13:30:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-12-16 03:37
反应物和产物各是什么?由你给的过渡态结构不能唯一确定这个反应是如何进行的

老师,您好,我这一步研究的是cis/tran异构,即以乙烯为例的话,异构前在C的对面,异构之后是在氧的对面

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发表于 Post on 2024-12-16 19:28:36 | 只看该作者 Only view this author
lzhu 发表于 2024-12-16 06:30
老师,您好,我这一步研究的是cis/tran异构,即以乙烯为例的话,异构前在C的对面,异构之后是在氧的对面

这个我感觉可以根据配体场理论解释吧,N杂环卡宾应该是比膦更强场的配体,酚氧负离子比磺酸根更强场,而强场配体有利于平面四方而不利于四面体构型。所以C,O配体更不容易形成四面体构型的过渡态,也就更难异构。可以用ORCA做个AILFT计算看看配体场参数。
这里能量分解分析发现C,O配体的形变更大,可能是因为配合物不愿采取四面体构型,所以过渡态结构需要做一些额外的扭曲,以避开完美的四面体构型
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-17 16:05:36 | 只看该作者 Only view this author
老师,我没用过ORCA这个软件,您说的ORCA做个AILFT计算看看配体场参数怎么做呀,还有这个程序的安装包哪里获得呀

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