一些化学信息学api

ggdh · 发表于 Post on 2017-2-15 21:09:46

本帖最后由 ggdh 于 2017-2-15 21:21 编辑

化学信息学api
建模，结构分析可以用到里面的一些功能，比如构象搜索，最小二乘面计算，芳香环检测等，

CIFONY
http://cinfony.github.io/

RDKit
http://www.rdkit.org/

Indigo Toolkit
http://lifescience.opensource.epam.com/indigo/index.html

openbabel
http://openbabel.org/

The Chemistry Development Kit
https://sourceforge.net/projects/cdk/files/

OEChem Toolkit
https://www.eyesopen.com/
欢迎大家补充

zsu007 · 发表于 Post on 2017-2-15 21:12:03

谢谢分享！

wangxubo · 发表于 Post on 2017-2-15 22:50:25

ccdc的新版本有一个python的接口支持很多偏向检索的功能https://downloads.ccdc.cam.ac.uk/documentation/API/ 参见这里

KiritsuguPapa · 发表于 Post on 2017-2-17 10:48:12

cclib: cclib.github.io 还在积极开发的主要是io相关的python库

greatzdk · 发表于 Post on 2017-4-25 12:42:25

greatzdk · 发表于 Post on 2017-4-25 12:45:05

CACTVS Chemoinformatics Toolkit Academic：http://www.xemistry.com/academic

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[综合交流] 一些化学信息学api