元动力学模拟过程中更改参数是否可行？

ljh123

我用CP2K+plumed进行元动力学模拟。想请教下各位高斯峰宽、高斯峰高、biasfactor等参数是否可以在模拟中途更改。比如前1ps和后1ps的高斯峰宽不同。这样还能否把2ps一起用于重构自由能面呢？

kirSTY

应该是可以。
按照楼主思路可以用plumed续算关键字，可以读取之前的CLOVER和HILL文件并续算。HILL文件中记录了你提到的参数，观察续算后HILL文件更新判更改参数断续算是否可行。
单纯合并前后两个HILL文件然后sumhill应该也是可行的。