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[CP2K] 求助:ener文档没有数据

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我的cp2k工作是正常运作的,restart, out文档也正常,但不知为何ener文档没有数据!

请问是否我的inp文档有问题:

#Generated by Multiwfn (http://sobereva.com/multiwfn)
&GLOBAL
  PROJECT 64CO2
  PRINT_LEVEL LOW
  RUN_TYPE MD
&END GLOBAL

#&EXT_RESTART
#  RESTART_FILE_NAME 64CO2-1.restart
#&END EXT_RESTART

&FORCE_EVAL
  METHOD Quickstep
  &SUBSYS
    &CELL
      A    21.10000000     0.00000000     0.00000000
      B     0.00000000    21.10000000     0.00000000
      C     0.00000000     0.00000000    21.10000000
      PERIODIC XYZ #Direction(s) of applied PBC (geometry aspect)
    &END CELL
    &COORD
      C           3.43000000    2.81000000   18.85000000
      O           4.30000000    2.05000000   18.69000000
      O           2.56000000    3.56000000   19.01000000
      C          12.63000000   12.84000000   20.22000000
      O          12.89000000   13.85000000   19.71000000
      O          12.36000000   11.83000000   20.74000000
      C           8.00000000   11.59000000    6.13000000
      O           7.79000000   12.66000000    6.53000000
      O           8.22000000   10.52000000    5.73000000
      C           8.09000000    0.92000000    8.04000000
      O           7.51000000    1.76000000    7.48000000
      O           8.66000000    0.08000000    8.59000000
      C           0.86000000    8.64000000   10.12000000
      O           1.26000000    9.12000000    9.14000000
      O           0.46000000    8.16000000   11.10000000
      C          16.04000000    6.53000000   11.78000000
      O          16.56000000    6.90000000   12.75000000
      O          15.51000000    6.17000000   10.81000000
      C           2.36000000    0.79000000    0.54000000
      O           3.32000000    0.18000000    0.34000000
      O           1.39000000    1.40000000    0.73000000
      C          16.58000000    4.02000000   12.77000000
      O          16.56000000    4.05000000   11.61000000
      O          16.59000000    3.99000000   13.93000000
      C           3.68000000   17.33000000    0.96000000
      O           4.58000000   16.83000000    0.43000000
      O           2.78000000   17.84000000    1.49000000
      C           9.68000000    8.40000000    7.34000000
      O          10.56000000    8.99000000    6.87000000
      O           8.79000000    7.81000000    7.80000000
      C          19.59000000   11.54000000   18.88000000
      O          19.27000000   12.65000000   18.99000000
      O          19.91000000   10.42000000   18.78000000
      C          13.19000000   19.92000000   14.73000000
      O          14.10000000   19.37000000   14.25000000
      O          12.29000000   20.47000000   15.20000000
      C          15.08000000    7.72000000   16.92000000
      O          14.51000000    6.80000000   16.48000000
      O          15.65000000    8.63000000   17.35000000
      C          13.27000000   11.62000000    0.49000000
      O          14.28000000   11.05000000    0.45000000
      O          12.26000000   12.19000000    0.52000000
      C           8.78000000    3.57000000    1.24000000
      O           9.59000000    4.10000000    1.88000000
      O           7.97000000    3.04000000    0.60000000
      C          17.88000000   16.45000000   17.27000000
      O          16.97000000   15.72000000   17.29000000
      O          18.79000000   17.17000000   17.25000000
      C          10.16000000    5.44000000    8.45000000
      O          11.10000000    6.08000000    8.69000000
      O           9.22000000    4.81000000    8.22000000
      C          19.60000000   17.82000000    9.93000000
      O          20.75000000   17.63000000    9.87000000
      O          18.46000000   18.00000000    9.98000000
      C          19.02000000    3.47000000    7.85000000
      O          18.49000000    4.34000000    7.32000000
      O          19.56000000    2.59000000    8.39000000
      C           2.86000000    6.91000000    3.74000000
      O           3.52000000    7.77000000    3.32000000
      O           2.19000000    6.05000000    4.15000000
      C          11.85000000    6.05000000    4.85000000
      O          12.43000000    5.78000000    3.89000000
      O          11.26000000    6.32000000    5.82000000
      C          14.19000000    6.20000000    6.49000000
      O          14.28000000    6.63000000    5.41000000
      O          14.10000000    5.76000000    7.56000000
      C           1.96000000   14.19000000    1.30000000
      O           1.99000000   15.35000000    1.27000000
      O           1.93000000   13.03000000    1.33000000
      C           3.61000000    7.26000000   19.99000000
      O           3.30000000    7.55000000   21.06000000
      O           3.94000000    6.97000000   18.91000000
      C           8.66000000    9.50000000   14.08000000
      O           9.47000000    9.47000000   13.25000000
      O           7.85000000    9.53000000   14.91000000
      C           9.48000000   19.80000000    8.62000000
      O           8.85000000   20.75000000    8.40000000
      O          10.11000000   18.85000000    8.84000000
      C           4.53000000   15.20000000    3.51000000
      O           3.70000000   16.01000000    3.43000000
      O           5.36000000   14.40000000    3.59000000
      C          12.50000000    2.38000000    7.42000000
      O          12.14000000    1.62000000    6.63000000
      O          12.86000000    3.15000000    8.21000000
      C          12.24000000   13.59000000    8.50000000
      O          12.76000000   14.62000000    8.63000000
      O          11.71000000   12.56000000    8.37000000
      C           8.18000000    3.81000000    3.80000000
      O           7.86000000    2.70000000    3.90000000
      O           8.49000000    4.93000000    3.70000000
      C          18.78000000   12.06000000    1.69000000
      O          19.84000000   12.49000000    1.87000000
      O          17.72000000   11.62000000    1.51000000
      C          17.36000000   11.38000000    9.31000000
      O          18.47000000   11.71000000    9.34000000
      O          16.24000000   11.06000000    9.28000000
      C          18.16000000    2.60000000   11.17000000
      O          17.50000000    2.10000000   11.99000000
      O          18.82000000    3.11000000   10.36000000
      C           4.57000000    0.15000000   14.90000000
      O           5.21000000    0.27000000   15.86000000
      O           3.93000000    0.02000000   13.94000000
      C          17.42000000   13.52000000   20.58000000
      O          16.36000000   13.59000000   20.09000000
      O          18.47000000   13.45000000   21.07000000
      C           4.88000000    5.03000000   14.68000000
      O           5.80000000    4.36000000   14.89000000
      O           3.95000000    5.70000000   14.48000000
      C          17.01000000   18.68000000   14.75000000
      O          16.36000000   18.81000000   13.80000000
      O          17.67000000   18.55000000   15.70000000
      C           5.49000000   19.70000000    2.32000000
      O           6.46000000   19.25000000    2.76000000
      O           4.51000000   20.15000000    1.89000000
      C           8.92000000    4.11000000   17.64000000
      O           9.56000000    3.43000000   16.94000000
      O           8.29000000    4.79000000   18.33000000
      C           9.08000000    3.13000000   11.30000000
      O           9.26000000    2.02000000   11.60000000
      O           8.90000000    4.24000000   10.99000000
      C          15.99000000   20.59000000   17.13000000
      O          16.20000000   20.10000000   18.16000000
      O          15.77000000   21.08000000   16.10000000
      C           4.66000000    1.04000000    7.33000000
      O           4.06000000    2.03000000    7.28000000
      O           5.27000000    0.05000000    7.38000000
      C           9.74000000   12.40000000    1.08000000
      O          10.33000000   11.43000000    1.33000000
      O           9.15000000   13.36000000    0.83000000
      C           7.41000000    9.76000000    3.26000000
      O           6.59000000    8.97000000    3.47000000
      O           8.23000000   10.56000000    3.06000000
      C          12.51000000   13.85000000   17.14000000
      O          11.94000000   14.87000000   17.14000000
      O          13.08000000   12.84000000   17.13000000
      C          19.01000000    4.60000000   16.11000000
      O          18.37000000    4.07000000   15.30000000
      O          19.65000000    5.14000000   16.92000000
      C          19.17000000   15.08000000    2.63000000
      O          19.70000000   14.73000000    1.66000000
      O          18.65000000   15.44000000    3.60000000
      C          15.43000000    9.22000000   14.18000000
      O          16.58000000    9.06000000   14.27000000
      O          14.29000000    9.39000000   14.09000000
      C           3.96000000   19.59000000   19.50000000
      O           4.89000000   19.90000000   18.87000000
      O           3.04000000   19.27000000   20.13000000
      C          19.17000000    9.36000000   11.67000000
      O          19.44000000   10.41000000   12.07000000
      O          18.89000000    8.30000000   11.27000000
      C           6.60000000   15.77000000    7.19000000
      O           7.46000000   15.65000000    7.96000000
      O           5.73000000   15.88000000    6.42000000
      C          15.64000000    0.46000000   10.69000000
      O          16.56000000    0.30000000   10.00000000
      O          14.72000000    0.63000000   11.37000000
      C          16.39000000   17.12000000    9.95000000
      O          16.11000000   17.70000000    8.98000000
      O          16.66000000   16.55000000   10.92000000
      C           0.89000000   15.27000000   17.18000000
      O           1.52000000   16.15000000   16.75000000
      O           0.26000000   14.39000000   17.61000000
      C          15.48000000    8.61000000    6.94000000
      O          16.16000000    7.78000000    6.50000000
      O          14.80000000    9.45000000    7.38000000
      C           4.88000000   17.27000000   11.71000000
      O           3.76000000   16.97000000   11.72000000
      O           6.00000000   17.58000000   11.69000000
      C           7.68000000   20.77000000   12.15000000
      O           7.01000000   20.52000000   13.07000000
      O           8.34000000   21.02000000   11.22000000
      C          15.82000000   18.02000000    4.24000000
      O          14.71000000   17.68000000    4.22000000
      O          16.94000000   18.35000000    4.27000000
      C           8.12000000   10.53000000   10.18000000
      O           9.05000000   10.76000000   10.83000000
      O           7.18000000   10.30000000    9.53000000
      C           0.61000000    9.27000000    5.69000000
      O           0.97000000    9.02000000    4.62000000
      O           0.25000000    9.52000000    6.77000000
      C          16.71000000   13.91000000   11.50000000
      O          17.77000000   14.30000000   11.75000000
      O          15.64000000   13.52000000   11.26000000
      C           1.28000000   11.31000000    4.96000000
      O           0.30000000   11.87000000    4.66000000
      O           2.25000000   10.75000000    5.26000000
      C           4.64000000   10.18000000    3.79000000
      O           4.71000000   10.44000000    4.92000000
      O           4.58000000    9.93000000    2.66000000
      C          17.76000000   20.07000000    6.21000000
      O          18.61000000   20.84000000    6.02000000
      O          16.91000000   19.30000000    6.40000000
    &END COORD
#   &VELOCITY #You can set initial atomic velocities in this section
#   &END VELOCITY
    &KIND C
      ELEMENT C
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH-q4
      POTENTIAL GTH-PBE-q4
    &END KIND
    &KIND O
      ELEMENT O
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH-q6
      POTENTIAL GTH-PBE-q6
    &END KIND
  &END SUBSYS

  &DFT
    BASIS_SET_FILE_NAME  BASIS_MOLOPT
    POTENTIAL_FILE_NAME  POTENTIAL
#   WFN_RESTART_FILE_NAME 64CO2-RESTART.wfn
    CHARGE    0 #Net charge
    MULTIPLICITY    1 #Spin multiplicity
    &QS
      EPS_DEFAULT 1.0E-10 #Set all EPS_xxx to values such that the energy will be correct up to this value
      EXTRAPOLATION ASPC #Extrapolation for wavefunction during e.g. MD. ASPC is default, PS can also be used
      EXTRAPOLATION_ORDER 3 #Order for PS or ASPC extrapolation. 3 is default
    &END QS
    &POISSON
      PERIODIC XYZ #Direction(s) of PBC for calculating electrostatics
      PSOLVER PERIODIC #The way to solve Poisson equation
    &END POISSON
    &XC
      &XC_FUNCTIONAL PBE
      &END XC_FUNCTIONAL
      &VDW_POTENTIAL
        POTENTIAL_TYPE PAIR_POTENTIAL
        &PAIR_POTENTIAL
          PARAMETER_FILE_NAME dftd3.dat
          TYPE DFTD3
          REFERENCE_FUNCTIONAL PBE
          #CALCULATE_C9_TERM T #Calculate C9-related three-body term, more accurate for large system
        &END PAIR_POTENTIAL
      &END VDW_POTENTIAL
    &END XC
    &MGRID
      CUTOFF  400
      REL_CUTOFF  50
    &END MGRID
    &SCF
      MAX_SCF 25 #Maximum number of steps of inner SCF
      EPS_SCF 1.0E-05 #Convergence threshold of density matrix of inner SCF
#     SCF_GUESS RESTART #Use wavefunction from WFN_RESTART_FILE_NAME file as initial guess
#     IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE #Continue calculation even if SCF not converged, works for version >= 2024.1
      &OT
        PRECONDITIONER FULL_ALL #Usually best but expensive for large system. Cheaper: FULL_SINGLE_INVERSE and FULL_KINETIC
        MINIMIZER DIIS #CG is worth to consider in difficult cases
        LINESEARCH 2PNT #1D line search algorithm for CG. 2PNT is default. 3PNT is more expensive but may be better. GOLD is best but very expensive
        ALGORITHM STRICT #Algorithm of OT. Can be STRICT (default) or IRAC
      &END OT
      &OUTER_SCF
        MAX_SCF 20 #Maximum number of steps of outer SCF
        EPS_SCF 1.0E-05 #Convergence threshold of outer SCF
      &END OUTER_SCF
      &PRINT
        &RESTART OFF #Do not generate wfn file to suppress meaningless I/O cost
        &END RESTART
      &END PRINT
    &END SCF
    &PRINT
      &MOMENTS
        PERIODIC T #Use Berry phase formula (T) or simple operator (F), the latter normally applies to isolated systems
      &END MOMENTS
    &END PRINT
  &END DFT
&END FORCE_EVAL

&MOTION
  &MD
    ENSEMBLE NVT
    STEPS 125000 #Number of steps to run
    TIMESTEP 0.2 #Step size in fs. Decrease it properly for high temperature simulation
    TEMPERATURE 318.15 #Initial and maintained temperature (K)
#   COMVEL_TOL 0 #Uncomment this can remove translation motion of center-of-mass every step
    &THERMOSTAT
      TYPE CSVR
      &CSVR
        TIMECON 200 #Time constant in fs. Smaller/larger results in stronger/weaker temperature coupling
      &END CSVR
    &END THERMOSTAT
    &PRINT
      &ENERGY
        &EACH
           MD     1000 #Output frequency of cell, 0 means never
        &END
      &END ENERGY
      &PROGRAM_RUN_INFO
        &EACH
          MD     1 #Output frequency of MD information, 0 means never
        &END EACH
      &END PROGRAM_RUN_INFO
    &END PRINT
  &END MD
  &PRINT
    &TRAJECTORY
      &EACH
        MD   1 #Output frequency of coordinates, 0 means never
      &END EACH
      FORMAT xyz
    &END TRAJECTORY
        &CELL
      &EACH
        MD     1000 #Output frequency of cell, 0 means never
      &END EACH
    &END CELL
    &VELOCITIES
      &EACH
        MD     1000 #Output frequency of velocities, 0 means never
      &END EACH
    &END VELOCITIES
    &FORCES
      &EACH
        MD     1000 #Output frequency of forces, 0 means never
      &END EACH
    &END FORCES
    &RESTART
      BACKUP_COPIES 0 #Maximum number of backing up restart file, 0 means never
      &EACH
        MD  1 #Frequency of updating last restart file, 0 means never
      &END EACH
    &END RESTART
    &RESTART_HISTORY
      &EACH
        MD     1000 #Output frequency of forces, 0 means never
      &END EACH
    &END RESTART_HISTORY
  &END PRINT
&END MOTION

64CO2.inp

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64CO2.out

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发表于 Post on 2024-12-28 22:35:46 | 只看该作者 Only view this author
&MOTION/&MD/&PRINT/&ENERGY/&EACH的MD被设成1000了,也就是每1000步输出一次信息到.ener文件,而从.out来看分子动力学连100步都没跑到。

好在下面&PROGRAM_RUN_INFO是1,还能从.out里MD|开头的行提取每一步的温度、势能、动能、守恒量等信息补救一下……

√546=23.36664289109

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