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[新手求助] 半胱氨酸形成的硫醚四面体的下一步,氧负离子进攻优先还是硫夺取氢质子优先?.

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各位老师好,遇见酶催化形成硫醚四面体结构,中性偏碱的条件下,遇到一个难题不知道进攻优先级的问题像各位老师请教,
①氧负离子进攻形成碳氧双键,形成硫负离子夺取质子供体氢
②硫先夺取质子形成硫正离子,进而氧负离子进攻。
不知道哪个应该优先?请各位老师赐教

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发表于 Post on 2024-12-30 04:29:26 | 只看该作者 Only view this author
大概率走(1)途径。一方面,硫醚的碱性很弱,难以从羧酸夺质子;另一方面,这里反应物消除掉硫负离子很可能是热力学有利的,不需要质子化来辅助
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-30 09:18:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-12-30 04:29
大概率走(1)途径。一方面,硫醚的碱性很弱,难以从羧酸夺质子;另一方面,这里反应物消除掉硫负离子很可 ...

好的多谢老师指教,顺便请教一下如果此处硫基团换成氨基,是不是应该先氨基质子化带正电,氧负离子再进攻脱落氨,碱性条件,因为看文献中似乎有这种例子。

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发表于 Post on 2024-12-30 17:37:35 | 只看该作者 Only view this author
zep 发表于 2024-12-30 02:18
好的多谢老师指教,顺便请教一下如果此处硫基团换成氨基,是不是应该先氨基质子化带正电,氧负离子再进攻 ...

对,因为氮负离子碱性太强了,离去性能太弱,与此同时胺很容易被羧基质子化
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-30 18:34:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-12-30 17:37
对,因为氮负离子碱性太强了,离去性能太弱,与此同时胺很容易被羧基质子化

好的好的多谢王老师指教,感谢

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