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[综合交流] MD中为什么说氦原子,建模原子明明没有

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请教大家分子动力学中建模原子没有He原子,为什么两篇文章都用氦。第一篇:为什么要说氦密度(前两张图煤大分子结构建模原子只有CHONS),第二篇:为什么要说探针分子:氦(第三张图干酪根大分子建模原子只有CHONS)

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发表于 Post on 2025-1-6 17:10:12 | 只看该作者 Only view this author
别自己在标题里手写[lammps]这种标签,会破坏论坛形象
当前问题没体现出和lammps的必然联系,发帖时别选择lammps分类
以后注意!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-1-6 18:03:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-1-6 17:10
别自己在标题里手写[lammps]这种标签,会破坏论坛形象
当前问题没体现出和lammps的必然联系,发帖时别选择 ...

好的社长 给您添麻烦了

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发表于 Post on 2025-1-6 22:04:00 | 只看该作者 Only view this author
He原子作为探针(和常见的第二周期原子C、N等半径相近,而且本来又是惰性气体原子而可以单独存在),用来得到孔洞尺寸之类,和体系实际有什么原子完全是两码事。下文介绍的我提出的范德华势分析也同样需要选择一个探针原子
谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制
http://sobereva.com/551http://bbs.keinsci.com/thread-17271-1-1.html
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值
http://sobereva.com/645http://bbs.keinsci.com/thread-30769-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-1-9 18:32:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-1-6 22:04
He原子作为探针(和常见的第二周期原子C、N等半径相近,而且本来又是惰性气体原子而可以单独存在),用来得 ...

明白了,感谢社长的回答与资料分享

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