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[综合交流] 求助sobeda方法能量分解的计算数值偏高

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使用Sobereva老师的sobeda方法进行结构的分解,安装包里的例子能够顺利算完且结果一致,但是针对我自己的结构分解后数值高达-633.51 kcal/mol,感觉格外的高,并且类似结构稳定在同一水平的高,我自己核对了分片段的顺序,没有发现问题,希望各位能帮忙看一下这么高的数值是否正常,或者知道我的问题所在,谢谢(sobEDA.sge.o16512为结果文件)

template.gjf

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输入模板

system.xyz

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结构坐标

fragment.txt

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片段分解

sobEDA.sge.o16512

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发表于 Post on 2025-1-8 20:37:44 | 只看该作者 Only view this author
不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了,以后注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-1-8 20:39:43 | 只看该作者 Only view this author
同时形成那么多配位键,而且还是真空下阴阳离子结合,再加上还同时形成了片段间的三个显著的氢键,总相互作用能不很高才怪
如果死活就是怀疑结果,先自己手动在同级别下计算总相互作用能并确保每个计算的波函数的稳定性,如果也是sobEDA.sh直接给出的那个数,就更体现出sobEDA的结果毫无问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-1-9 09:51:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 假如. 于 2025-1-15 17:24 编辑
sobereva 发表于 2025-1-8 20:39
同时形成那么多配位键,而且还是真空下阴阳离子结合,再加上还同时形成了片段间的三个显著的氢键,总相互作 ...
好的好的,老师我还有个新的问题,我想对相同配体通过不同配位方式的一系列结构进行片段间的总弱相互作用能(包括氢键以及片段间互斥等方面)的对比,来说明某些配位方式的优越性,并且与ΔG方面的得到的结论来相互印证,所以为了排除作用力较强的配位键,我通过不同的片段分法想通过手动减去配位键的作用能以得到其他弱相互作用能的数值,但是得到的二片段分法总作用能更强。
1.由于是锕系原子,是否是我选择的方法基组造成的数据反常?
2.这结果是合理且值得分析的么?如果是合理的从什么方面进行分析较为合适?
3.有没有其他方式能够在排除铀形成的配位键的前提下进行其他部分作用能的分解分析?(因为其实二片段分法也忽略了其他配体有可能与铀酰氧分子形成的氢键作用)

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