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[新手求助] 求助不同预优化结构使用gaussian是否能得到相同结果

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各位老师好,我有一批分子结构需要用gaussian进行热力学数值计算并进行对比,前面有几个分子用的MMFF94力场进行预优化,然后现在有个分子用MMFF预优化完再用gaussian dft计算结构时SCF不收敛,但MM2能正常计算,想问下这会影响不同结构之间热力学数值的对比么?

我也比较好奇,比如同一个分子分别用MMFF94和MM2力场预优化,使用相同的方式进行opt freq计算最后结构是否会相同呢?

我知道dft是从头算,但是不是很清楚这个从头算是指只要分子固定,不管初始结构怎样,在相同的基组和泛函下都能优化得到相同结构,还是说在初始结构相同的情况下经过相同计算的结果是相同的。谢谢各位老师。

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发表于 Post on 2025-1-9 13:13:38 | 只看该作者 Only view this author
与量子化学无关,这是常识问题,有的分子有多个稳定构象,不同量化程序、不同优化算法、不同初始结构,有可能导致优化结果是不同的局域极小点。如果体系极其刚性,只有一个局域极小点,也是全局极小点,那无论用什么方法优化,在KS-DFT给定的计算级别下最终都是同一个结构。这跟山脉山谷是一个道理。自行根据体系特点判断。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-1-9 13:18:36 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-1-9 13:13
与量子化学无关,这是常识问题,有的分子有多个稳定构象,不同量化程序、不同优化算法、不同初始结构,有可 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2025-1-9 23:52:01 | 只看该作者 Only view this author
我也比较好奇,比如同一个分子分别用MMFF94和MM2力场预优化,使用相同的方式进行opt freq计算最后结构是否会相同呢?

问这种问题说明你应当了解构象搜索的知识。仔细看
构型和构象搜索程序Molclus主页:http://www.keinsci.com/research/molclus.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
Molclus FAQ
http://sobereva.com/730http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

对于势能面复杂、极小点很多的柔性大体系,不同力场极有可能优化到不同极小点附近,因而进一步用DFT优化也会得到不同结果。这种情况需要用molclus做构象搜索,确保最后得到的是势能面最小点对应的结构。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-1-10 11:25:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-1-9 23:52
问这种问题说明你应当了解构象搜索的知识。仔细看
构型和构象搜索程序Molclus主页:http://www.keinsci. ...

好的,谢谢sob老师!

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