ORCA2EASYSPIN计算失败

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2025-1-16 22:46:24

一开始在输入Sys=orca2easyspin('Ori-Twist2OPT3.out')出了下面一大堆的提示，但是没有报错。

No Mulliken analysis found for structure 1 of 1.
eulang: Rotation matrix is not orthogonal, deviation is 9.60862e-08.
eulang: Orthogonalizing using singular-value decomposition (SVD).
eulang: Rotation matrix is not orthogonal, deviation is 8.83263e-08.
eulang: Orthogonalizing using singular-value decomposition (SVD).
eulang: Rotation matrix is not orthogonal, deviation is 1.023e-07.
eulang: Orthogonalizing using singular-value decomposition (SVD).
后面全是类似上面两行文字不断重复，数值略有不同。

最后在运行pepper(Sys,Exp);出了下面一堆错，计算也停了，要怎么解决？

Error using full
Requested array exceeds the maximum possible variable size.

Error in ham_zf

Error in ham

Error in resfields

Error in pepper

Error in compisoloop

Error in pepper

Related documentation

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-1-16 22:54:48

删掉那些特别小的、即使忽略也不影响算出来的谱图的A值。然后再试

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2025-1-18 22:58:33

wzkchem5 发表于 2025-1-16 22:54
删掉那些特别小的、即使忽略也不影响算出来的谱图的A值。然后再试

请问一下如何删除A值

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-1-19 03:07:42

mfdsrax2 发表于 2025-1-18 15:58
请问一下如何删除A值

matlab自带的帮助文件讲了如何从一个数组里删除特定的元素

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2025-1-20 20:25:20

wzkchem5 发表于 2025-1-19 03:07
matlab自带的帮助文件讲了如何从一个数组里删除特定的元素

你好，我输出了Sys和Sys.A，是要把A里面那些绝对值很小的数据删掉吗？AFrame，Q和QFrame需不需要同时删

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-1-20 21:44:10

mfdsrax2 发表于 2025-1-20 13:25
你好，我输出了Sys和Sys.A，是要把A里面那些绝对值很小的数据删掉吗？AFrame，Q和QFrame需不需要同时删

对，AFrame、Q、QFrame需要同时删
不过你这个计算里面大部分A值绝对值都很大，即使删掉前4个氢，用处也不大。可以考虑把A值相似的氢核合并一下，让程序认为这几个氢核严格等价

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2025-1-20 22:24:47

wzkchem5 发表于 2025-1-20 21:44
对，AFrame、Q、QFrame需要同时删
不过你这个计算里面大部分A值绝对值都很大，即使删掉前4个氢，用处也 ...

请问一下合并是什么操作？删除掉数值接近的，还是说把接近的数值改成一样的？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-1-20 23:07:03

mfdsrax2 发表于 2025-1-20 15:24
请问一下合并是什么操作？删除掉数值接近的，还是说把接近的数值改成一样的？

easyspin有特殊的语法可以指定若干个等价核，好像是改Sys.n，可以查一下手册

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2025-2-9 16:28:20

wzkchem5 发表于 2025-1-16 22:54
删掉那些特别小的、即使忽略也不影响算出来的谱图的A值。然后再试

王老师再请问下，有没有办法可以增加MatLab可以调用的内存

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-2-10 15:55:12

mfdsrax2 发表于 2025-2-9 09:28
王老师再请问下，有没有办法可以增加MatLab可以调用的内存

MATLAB应该是默认用所有的内存。所以应该想办法减少你这个计算需要的内存，而不是想办法让MATLAB能调用更多的内存。
easyspin需要的内存和A值的数量成指数关系

mfdsrax2 · 发表于 Post on 2025-2-10 20:51:25

wzkchem5 发表于 2025-2-10 15:55
MATLAB应该是默认用所有的内存。所以应该想办法减少你这个计算需要的内存，而不是想办法让MATLAB能调用更 ...

我在服务器上装了Matlab，有512GB的内存，仍然提示相同的错误，应该不是内存容量的问题。我看设置里面有一个最大数组大小的选项，但是最大就是10000，是这个的限制吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-2-10 21:10:12

mfdsrax2 发表于 2025-2-10 13:51
我在服务器上装了Matlab，有512GB的内存，仍然提示相同的错误，应该不是内存容量的问题。我看设置里面有 ...

我已经说过了，随着A值数目的增加，需要的内存成指数增加。所以512GB仍然不够用是极其有可能的

hu520130 · 发表于 Post on 2025-3-25 10:59:40

wzkchem5 发表于 2025-1-20 21:44
对，AFrame、Q、QFrame需要同时删
不过你这个计算里面大部分A值绝对值都很大，即使删掉前4个氢，用处也 ...

王老师，您好，我也是遇到说数组太大超过内存了，然后我输出了Sys和Sys.A后，用ans = ans([2 3 4 5], :)删掉相应不要的数据后，后续需要怎么操作呢？怎么让MATLAB记住现在的数组，并进行后续的这个pepper(Sys,Exp)指令并生成图像呢？这两天刚初学，希望王老师指导一下，不胜感激！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-3-25 12:51:43

hu520130 发表于 2025-3-25 10:59
王老师，您好，我也是遇到说数组太大超过内存了，然后我输出了Sys和Sys.A后，用ans = ans([2 3 4 5], :) ...

用Sys.A = Sys.A([2 3 4 5], :)就行
这种问题问deepseek一般能得到靠谱的答案

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