USPEX使用问题

氢原子 · 发表于 Post on 2017-2-23 10:44:11

我刚学习USPEX软件，在Linux下运行之后，OUTPUT文件总是出现附件中的提示信息，然后就停止运算了，软件输入文件是给定的例子，没有什么问题。网上有人说没有调试好，像这种情况如何调试呢？

get-it · 发表于 Post on 2017-2-23 12:58:18

USPEX的计算目录是CalcFold*，可以进去看看输入文件是否写对

氢原子 · 发表于 Post on 2017-2-27 10:55:10

get-it 发表于 2017-2-23 12:58
USPEX的计算目录是CalcFold*，可以进去看看输入文件是否写对

输入文件应该没有问题，我是跑的例子EX09，只改了调用VASP的方式和集群，然后就一直在产生第一代结构时出错，进行不下去。现在不知道原因在哪儿了

get-it · 发表于 Post on 2017-2-27 14:53:51

氢原子发表于 2017-2-27 10:55
输入文件应该没有问题，我是跑的例子EX09，只改了调用VASP的方式和集群，然后就一直在产生第一代结构时出 ...

你是不是用了并行模式，whichCluster设的是多少？

氢原子 · 发表于 Post on 2017-2-27 21:42:56

get-it 发表于 2017-2-27 14:53
你是不是用了并行模式，whichCluster设的是多少？

是的，我用脚本多核提交到超算上的，whichCluster设的1，INPUT设置和脚本如下

get-it · 发表于 Post on 2017-2-27 21:54:54

氢原子发表于 2017-2-27 21:42
是的，我用脚本多核提交到超算上的，whichCluster设的1，INPUT设置和脚本如下

USPEX的并行太简陋了，你先试下串行，成功之后在改脚本并行计算

氢原子 · 发表于 Post on 2017-2-28 08:42:25

get-it 发表于 2017-2-27 21:54
USPEX的并行太简陋了，你先试下串行，成功之后在改脚本并行计算

因为我想预测有机分子的空间群，原子比较多，所以想用并行算的快点。听您这么说的话，那我先串行跑通试试。如果串行的话，像例子EX09这样与VASP连用的，commandExecutable这儿怎么写呢？

get-it · 发表于 Post on 2017-2-28 10:15:49

氢原子发表于 2017-2-28 08:42
因为我想预测有机分子的空间群，原子比较多，所以想用并行算的快点。听您这么说的话，那我先串行跑通试试 ...

把运行vasp的命令写上就行

氢原子 · 发表于 Post on 2017-2-28 14:56:01

get-it 发表于 2017-2-28 10:15
把运行vasp的命令写上就行

好的，谢谢您，我先试试

qianwangscu · 发表于 Post on 2023-11-10 19:21:59

请问楼主解决了吗？我也是运行EX09，在第一代就报错了。用的1个节点，不存在并行的问题。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[其它程序] USPEX使用问题