小课题组-15w单路AMD 9654服务器装机配置购买求助

JonasWANG

各位老师元宵节快乐！我想请教一下单路志强六代6740E与AMD 9654服务器购买用于做AI+药物筛选，譬如DOCK，谁更推荐？（最近发现暂时用的比较多的是gromacs或amber）

1.前言（可略过）：
本人是新入学的研究生一名，导师想要我去做AI+苗头化合物药物筛选方向，但我本科阶段接触的都是湿实验，平时对于代码和计算机相关的了解也较少。导师秉着工欲善其事必先利其器的想法，给了我十万块让我先配台主机。因此这几天我逛遍各大论坛，咨询十几个销售，最后大概配置出了一套方案（不带专票税，超出10w小几千，4090显卡*4超过8w一些）（选志强是因为导师偏向志强的CPU，说志强的稳定些，我不太懂CPU，也不知道志强比AMD好在哪，便也就没有与之讨论）
【CPU 】intel 8581C 2.1G 60核；
【主板】技嘉MS03-CE0；
【内存】三星 48G DDR5-4800MHZ REGECC *8；
【散热】猫头鹰NH-U14S TR4-SP3双风扇
【固态硬盘】三星2TB 990PRO；
【机械硬盘】16TB 希捷 sata 企业盘*2；
【显卡】RTX 4090 24G*4；
【电源】长城2600W黑匣子；
【机箱】定制11槽位 塔式 4GPU），
其中特别感谢Sobereva老师所发的购机配置推荐（网址http://sobereva.com/444和http://bbs.keinsci.com/forum.php ... digest%26digest%3D1），
以及Entropy.S.I老师所发的4090测试（网址http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=33296&extra=page%3D1%26filter%3Ddigest%26digest%3D1）
导师对于整体方案大致满意，但是，导师认识一个Intel公司的

朋友，说六代志强要远远好于五代志强，便又让我重新配置六代志强的服务器，预算是不超过11w，也因此有了此次求助




2.具体事宜
在11w预算的前提下，本人找销售能够升级六代志强的配置如下（需更换主板和内存，其他不变，带税价格涨了8000左右，其中6740E为13000，比8581C贵了4200，而其他六代志强要2.5w起）：
【CPU 】XEON六代单路 6740E 96核心 2.4G
【主板】技嘉MS04-CE0
【内存】三星48GB ECC REG DDR5-5600


秉着性价比的原则，本人搜寻了六代志强的相关测试，找到几位老师的帖子（a9471163-http://bbs.keinsci.com/thread-51358-1-1.html，BakaHDT-https://www.bilibili.com/opus/944593699323510820），发现据测试结果显示：AMD9754 2P以多出17%的功耗领先 6780E 2P 39%，其中单路的9754 128核仅被对面双路288核的6780E领先了5%

因此，本人有以下几个问题咨询各位大佬：
1.此次升级是否有必要？
2.如果更换6740E，猫头鹰NH-U14S TR4-SP3双风扇散热能压住吗？（课题组有机房，不考虑噪音，仅考虑散热）如果不能各位老师有什么其他推荐或者修补建议呢？
3.如果换成AMD的CPU，11w预算内，上9654单路（1.4w的价格，与6740E为1.3w相差不远），是否性能更好？对于做AI+药物筛选，譬如DOCK是否有影响？

欢迎各位老师给予宝贵的建议，并祝各位老师：新的一年，身体健康，万事如意，财源广进，事业爱情双丰收！
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（手动划线）

2025-02-20

感谢各位大佬的建议，目前跟导师商量了一下，与其升级志强六代6740E，不如AMD yes！！！了！！！由于4090的涨价，没办法，预算也往上加了一些。

现在具体配置如下，总体预计138000，烦请各位大佬再看看是不是合理，或者还有没有优化的地方。十分感谢！！！

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（手动划线）

2025.02.25

导师组会听完一篇AI药筛的CELL汇报之后决定继续加大服务器配置的投入！！！

现在预算来到了15W+，说预算充足，他觉得需要再上12根DDR5 4800 48G，来个1152G的运行内存，但一根八百多，上12根内存就一万块了

我有个想法，多这个一万块，为什么不直接上双路9654？？？？？

求助大佬们给点建议！尤其是有没有做结构方向的老师！！！


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（手动划线）

2025.03.02

破案了，上周去学习发现，最近用的比较多的软件是gromacs或amber


求助各位看看最终配置，如果没啥问题的话，下周就开始采购了

sss668800

(1)6代至强现在还没有便宜的配置，一颗6740E可能就比你8581c+主板+内存还贵了，远超你的预算。

(2)你引用的帖子里面写的，由于6740E是E核，性能远比8581C的弱。如果是P核的6980P，单颗可能就要10万以上了。

(3)你写的配置，内存4800浪费了带宽，建议换成DDR5 5600，价钱差别很小

sunlin3685

6代志强，分成2个系列，目前是4710接口的E核，性能太弱；还有就是7529接口的P核，性能强；还没零售出货，价格会超乎你的想象；

JonasWANG

sss668800 发表于 2025-2-14 09:58
(1)6代至强现在还没有便宜的配置，一颗6740E可能就比你8581c+主板+内存还贵了，远超你的预算。

(2)你引 ...

好的好的，谢谢大佬的的提醒，我这就和导师重新商量去，十分感谢您！
6740E我也觉得没必要，比8581c贵4200，主板又要升级+1500
内存条我立马就换了去

JonasWANG

sunlin3685 发表于 2025-2-14 14:49
6代志强，分成2个系列，目前是4710接口的E核，性能太弱；还有就是7529接口的P核，性能强；还没零售出货，价 ...

是的是的，其他六代最便宜的都要2.5w起

所以我在思考老师要是愿意多花这个钱，不如直接上9654

zdb

1.你这个预算目前阶段很难搭配了，首先4090的价格基本都是2W了，剩下2W，不够了，这还是你自己买配件自己动手组装的情况下，你走供应商的话最少得往上加十个点左右（这已经是最最良心供应商了）
2.看你用塔式机箱，估计没有专门的机房，四张4090塔式只能用涡轮卡，噪音下不来，如果改液冷，还得占用预算

sss668800

JonasWANG 发表于 2025-2-14 15:40
好的好的，谢谢大佬的的提醒，我这就和导师重新商量去，十分感谢您！
6740E我也觉得没必要，比8581c ...

哦对了，内存我当时没有注意看，建议48G内存改成32或者64G，兼容性更好

JonasWANG

zdb 发表于 2025-2-17 10:16
1.你这个预算目前阶段很难搭配了，首先4090的价格基本都是2W了，剩下2W，不够了，这还是你自己买配件自己动 ...

好的好的，谢谢大佬，我们是有机房的，但是不目前不考虑用液冷，然后是打算上开源宇宙的四卡机箱加上四张4090三风扇卡，这样散热可以了吗

zdb

是这种的吗

先行者2015

zdb 发表于 2025-2-21 13:03
是这种的吗

请问这个是什么机箱型号啊？

JonasWANG

zdb 发表于 2025-2-21 13:03
是这种的吗

是的，您找的应该是六卡型号的，我选的是同一个厂商的四卡机箱，目前淘宝有出售的，能装四卡的（三风扇，非涡轮卡，），非液冷方案散热的机箱，我目前只找到这一种型号（该机箱也可液冷），或者有服务器公司会有自己定制的四卡风冷机箱

gog

这标题，导师看到之后，该怎么回怼？

lmch

你们组用的软件对大规模CPU并行的支持好么？ GPU类计算的话，9654 的单核性能够用吗？

JonasWANG

lmch 发表于 2025-2-28 11:46
你们组用的软件对大规模CPU并行的支持好么？ GPU类计算的话，9654 的单核性能够用吗？

大佬好，上周去学习才知道，后面暂时用的比较多的软件是gromacs或amber

lmch

JonasWANG 发表于 2025-3-4 17:19
大佬好，上周去学习才知道，后面暂时用的比较多的软件是gromacs或amber

gmx还是需要单核性能相对强一些的CPU，建议再找渠道测试对比一下。