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[VMD] 求助VMD绘制静电式分布图时电子密度等值面着色法(ESPiso)及IGMH绘图全为白色问题

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本帖最后由 BaleQi 于 2025-2-20 14:51 编辑

最新排查结果:
1.在发帖前就已尝试1.9.3版本及更改安装目录至 K/VMD(无空格且简单的安装目录),也确认了在c盘带空格的安装路径是加了“”的,结果同样无法着色。
2.ESPiso.bat或ESPpt.bat里的VMD路径设置正确。
3.bat文件里给Multiwfn用的输入文件的路径正确且为fch文件。(若输入错误则我不会能绘制出pt图形)
4.确认了的.vmd后缀的脚本文件都放到了VMD默认的目录下了。
5.确认修改过vmd.rc了,且保存了此文件后再启动vmd。
6.仔细阅读了621帖子,我是计算的带-1电荷的体系,因此也修改了极值点对应的范围,同样无法解决报错并渲染上色。
7.也单独只运行ESPiso.bat,同样无法解决。

我仔细又排查了vmd运行时的log文件,发现使用iso绘制ESP图时,出现了报错:Warning) OpenGL Programmable Shading not available.
不知道问题是不是处在vmd shading上?如果问题出在这里,应该如何解决呢?

原问题
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在使用Guass计算相互作用后在VMD渲染ESP图和IGMH时,尝试各种Graphical Representations中的Draw style和Trajectory 中的color scale data range参数,都无法显示和渲染出正常颜色。但很奇怪的是使用pt点阵绘制ESP图时,却能正常显示。请问这种情况是我哪里设置错误了呢?该如何解决?
PS:已尝试重装Multiwfn和VMD,并多次尝试批处理多个fch文件,都是遇到相同问题。

1FA64BDBC3606E7FC00909D0AB5E00AA.png (79.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

ISO着色失败

ISO着色失败

微信截图_20250219173349.png (347.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

IGMH着色失败

IGMH着色失败

微信截图_20250219172505.png (450.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

pt着色正常

pt着色正常

3.png (112.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

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2.png (304.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

vmd中的报错信息

vmd中的报错信息

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vmd渲染参数排查结果

vmd渲染参数排查结果

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发表于 Post on 2025-2-19 18:01:41 | 只看该作者 Only view this author
仍处于开发中的VMD 1.9.4a53版容易出故障,改成稳定版本1.9.3再尝试。另外安装VMD时别装到默认的C:\Program Files这种又长又含空格的路径下,绘制时Display - Rendermode切换到GLSL。
√546=23.36664289109

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发表于 Post on 2025-2-19 18:04:55 | 只看该作者 Only view this author
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
文末的红字部分都写得极为清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-19 23:48:59 | 只看该作者 Only view this author
感谢sob老师和uus老师指导,我仔细阅读和排查了443帖中文末故障排查方法,但仍无法解决报错问题。排查过程如下:
1.在发帖前就已尝试1.9.3版本及更改安装目录至 K/VMD(无空格且简单的安装目录),也确认了在c盘带空格的安装路径是加了“”的,结果同样无法着色。
2.ESPiso.bat或ESPpt.bat里的VMD路径设置正确。
3.bat文件里给Multiwfn用的输入文件的路径正确且为fch文件。(若输入错误则我不会能绘制出pt图形)
4.确认了的.vmd后缀的脚本文件都放到了VMD默认的目录下了。
5.确认修改过vmd.rc了,且保存了此文件后再启动vmd。
6.仔细阅读了621帖子,我是计算的带-1电荷的体系,因此也修改了极值点对应的范围,同样无法解决报错并渲染上色。
7.也单独只运行ESPiso.bat,同样无法解决。

我仔细又排查了vmd运行时的log文件,发现使用iso绘制ESP图时,出现了报错:Warning) OpenGL Programmable Shading not available.
不知道问题是不是处在vmd shading上?如果问题出在这里,应该如何解决呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-19 23:49:52 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-2-19 18:01
仍处于开发中的VMD 1.9.4a53版容易出故障,改成稳定版本1.9.3再尝试。另外安装VMD时别装到默认的C:\Program ...

感谢帮助!我尝试了您说的两种方法,但还是无法解决

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-19 23:53:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 BaleQi 于 2025-2-19 23:57 编辑
sobereva 发表于 2025-2-19 18:04
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva. ...

哇!感谢sob老师秒回我的帖子!我又仔细按照443贴子末尾的问题排查方法一一排查了,但还是无法解决。在仔细排查过程中发现了vmd运行时出现了有关OpenGL Programmable shading 的报错,这是否会是我遇到问题的关键呢?如果是该如何解决呢?
感谢sob老师!
PS:排查结果已在帖子第一层更新。

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发表于 Post on 2025-2-19 23:58:24 | 只看该作者 Only view this author
BaleQi 发表于 2025-2-19 23:49
感谢帮助!我尝试了您说的两种方法,但还是无法解决

估计电脑显卡有兼容性问题,可以尝试更新驱动。如果仍然没法解决,只能从Tachyon渲染出来再观察效果了,参考http://sobereva.com/291的1.4节第三段。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-20 08:42:15 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-2-19 23:58
估计电脑显卡有兼容性问题,可以尝试更新驱动。如果仍然没法解决,只能从Tachyon渲染出来再观察效果了, ...

我感觉应该不是显卡问题,因为之前绘制过其他分子的ESPiso,当时渲染挺正常的。但过了几天不知道怎么就出现现在这样的问题了。

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发表于 Post on 2025-8-4 10:45:58 | 只看该作者 Only view this author
请问这个问题i解决了吗 我也遇到了相同问题

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