计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 488|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 高斯计算过渡金属离子溶解自由能该使用什么溶剂模型?

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

103

eV
积分
111

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 取不起名字 于 2025-2-25 09:58 编辑

各位大神好,我目前已经在IEFPCM溶剂模型下对钼离子配合水分子和氢氧根离子的结构进行了优化,在计算溶解自由能时遇到了问题如下:
1. 由于钼离子已经与水分子进行了配位,那么是否意味着我在隐式溶剂模型下计算溶解自由能就可以了?还是说我需要在杂化溶剂模型下计算?
2. 如果在隐式溶剂模型下计算就可以,我计算的体系涵盖了电荷数-2~+2的配合物结构,那使用uESE更好还是SMD?如果需要用杂化溶剂模型,那么可以提供一点文献参考吗?
希望各位大神可以指点迷津,谢谢大家!


6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120148

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2025-2-25 11:58:01 | 只看该作者 Only view this author
如果算的就是配合物的溶解自由能,隐式溶剂模型一般就够了。建议uESE
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

266

帖子

0

威望

937

eV
积分
1203

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2025-2-25 16:15:40 | 只看该作者 Only view this author
uESE不是很稳定。建议看一下你的体系算这些量需不需要对比。金属配合物体系可能涉及到好几种带电状态,我试过有一些体系带个+1、+2之类的算出来比SMD准,但是中性下又远不如SMD。

8

帖子

0

威望

103

eV
积分
111

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-26 09:57:12 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2025-2-25 16:15
uESE不是很稳定。建议看一下你的体系算这些量需不需要对比。金属配合物体系可能涉及到好几种带电状态,我试 ...

谢谢您的解答。我想算质子化过程的吉布斯自由能变,算的体系带的电荷数是从-2~+2的,包含了中性的配合物,但理论方法和基组需要统一的。

8

帖子

0

威望

103

eV
积分
111

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-26 13:12:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-25 11:58
如果算的就是配合物的溶解自由能,隐式溶剂模型一般就够了。建议uESE

谢谢老师的解答。我还有一个问题:我的目的是计算溶质在溶剂中的自由能,需要气相自由能+溶解自由能,您提到这两个部分得分别尽量算准确。那么我可以在原先用IEFPCM溶剂模型下优化的结构算高精度单点能,在B3LYP/def2TZVP下优化的结构算溶解自由能吗?还是说必须统一用一个结构,我看了您的博文后感觉用B3LYP/def2TZVP对过渡金属配合物的优化不太合适,因此对于气相自由能的计算有些迷惑。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 02:01 , Processed in 0.233663 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list